Excavats

Els excavats (Excavata) són un gran clade dintre dels eucariotes. El clade conté una gran varietat de formes de vida lliure i simbiòtiques, i inclou alguns paràsits importants entre els humans. Diversos excavats estan mancats dels clàssics mitocondris - aquests organismes estan sovint referits com a "amitocondriats", tot i que la majoria retenen un orgànul mitocondrial enormement modificat. D'altres tenen mitocondris amb crestes tubulars, discoïdals o en alguns casos planes. La majoria d'excavats tenen dos, quatre o més flagels i molts tenen una ultraestructura característica mantinguda per microtúbuls que els serveix per a l'alimentació. Tanmateix, hi ha diversos grups mancats d'aquests trets que són considerats excavats degut a l'evidència genètica.

Excavats

Excavata
Trichomonas vaginalis
Taxonomia
Superregne	Eukaryota
Regne	Protozoa
Infraregne	Excavata Caval.-Sm., 2002
Fílums
Metamonada Loukozoa Euglenozoa Percolozoa

Els excavats es classifiquen en quatre grups que poden ser tractats com a fílums:

Metamònads	p.ex. Giardia, Trichomonas	Amitocondriats, la majoria simbionts amb animals
Loukozous	p.ex. Jakoba
Percolozous	p.ex. Naegleria, Acrasis	La majoria amb formes entre flagel·lades i ameboides
Euglenozous	p.ex. Euglena, Trypanosoma	Diversos paràsits importants, un gran grup amb cloroplasts

D'aquests, els percolozous i euglenozous semblen ser parents particularment relacionats i estan units per la presència de crestes mitocondrials discoides. La majoria de loukozous tenen crestes tubulars, com molts altres eucariotes, mentre que els metamònads són inusuals per haver perdut els clàssics mitocondris - tot i que ells tenen "hidrogenosomes", "mitosomes" o orgànuls no caracteritzats. Les relacions dels excavats encara romanen incertes; és possible que no siguin un grup monofilètic.

Certs excavats són sovint considerats entre els eucariotes més primitius, basant-se particularment en la seva posició en diversos arbres evolutius. Això podria esperonar les investigacions que proposessin que és parafilètic amb altres clades eucariotes. Tanmateix, la posició de certs excavats en "branques basals" podria ser un artefacte causat per l'atracció entre branques llargues, com ha estat vist en alguns altres grups, com per exemple els microsporidis.

Subgrups

Els excavats es classifiquen dins sis subdivisions principals a nivell de fílum/classe. Es mostren a la taula de sota. Un organisme addicional, Malawimonas, també es pot incloure dins els excavats, malgrat que l'evidència filogenètica és equívoca.

Superfílum	Fílum/Classe	Gèneres representatius	Descripció
Discoba o JEH	Euglenozoa	e.g. Euglena, Trypanosoma	Paràsits molt importants que tenen cloroplasts
	Heterolobosea (Percolozoa)	e.g. Naegleria, Acrasis	La majoria alternen formes flagel·lades i ameboides
	Jakobea	e.g. Jakoba, Reclinomonas	De vida lliure
Metamonada o POD	Preaxostyla	e.g. Oxymonads, Trimastix	Trimastix és de vida lliure
	Fornicata	e.g. Giardia, Carpediemonas	Paràsits d'animals.
	Parabasalia	e.g. Trichomonas	En insectes, alguns són patògens en humans.

Discoba o clade JEH

Euglenozoa i Heterolobosea (Percolozoa) semblen estar estretament relacionats i estan units per la presència de cristalls discoides dins els mitocondris (Superfílum Discicristata). Més recentment s'ha trobat una relació estreta entre Discicristata i Jakobida,^[1] t

Cladograma

El següent arbre filogenètic mostra les relacions entre els diferents grups de excavats:^[2][3]

Eukaryota	Diphoda  Corticata  SAR  Stramenopiles Alveolata Rhizaria  Hacrobia  Plantae Hemimastigophora Discoba Metamonada  Opimoda  Ancyromonadida Malawimonadea Podiata Varisulca  Unikonta  Amoebozoa Obazoa Breviatea Apusomonadida Opisthokonta Holomycota Fungi Holozoa Animalia

Referències

1. Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang «Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans». Curr. Biol., 17, 16, 8-2007, pàg. 1420–1425. DOI: 10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID: 17689961.
2. Brown, M. W., Heiss, A. A., Kamikawa, R., Inagaki, Y., Yabuki, A., Tice, A. K., ... & Roger, A. J. (2018). Phylogenomics places orphan protistan lineages in a novel eukaryotic super-group. Genome biology and evolution, 10(2), 427-433.
3. Romain Derelle et al 2015, Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root. Proceedings of the National Academy of Sciences 112(7) · January 2015 with 248 Reads DOI: 10.1073/pnas.1420657112

• Cavalier-Smith, T. «The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 52, 2002, pàg. 297-354.
• Alastair G. B. Simpson «Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious tàxon Excavata». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 53, 2003, pàg. 1759-1777.