Dicer

Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip (siRNAs i miRNAs) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat.

Dicer
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ
Identificadors
Àlies	DICER1 (HUGO), DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
Identif. externs	OMIM: 606241   MGI: 2177178   HomoloGene: 13251   GeneCards: DICER1   OMA: DICER1 - orthologs
Malalties relacionades genèticament
pleuropulmonary blastoma , embryonal rhabdomyosarcoma , DICER1 syndrome , familial multinodular goiter  [1]
Localització del gen (humà) Cromosoma: 14 (humà)[2] Banda 14q32.13 Inici 95.086.228 bp[2] Fi 95.158.010 bp[2]
Localització del gen (ratolí) Cromosoma: 12 (ratolí)[3] Banda 12 E|12 54.83 cM Inici 104.654.001 bp[3] Fi 104.718.211 bp[3]
Patró d'expressió d'ARN Bgee humà ratolí (ortòleg) Més explicacions tail of epididymis  caput epididymis  nervi òptic os esponjós corpus epididymis  mucosa of paranasal sinus  visceral pleura  cavitat oral  parietal pleura  inferior ganglion of vagus nerve  Més explicacions zigot secondary oocyte  primary oocyte  tail of embryo  genital tubercle  mandibular prominence  medullary collecting duct  corpuscle renal abdominal wall  primitive streak  Més referències a dades d'expressió BioGPS
Ontologia genètica Funció molecular unió de nucleòtids  helicase activity  protein domain specific binding  pre-miRNA binding  metal ion binding  endoribonuclease activity  endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters  unió proteica  siRNA binding  RNA binding  nuclease activity  double-stranded RNA binding  endonuclease activity  activitat hidrolasa  unió d'ATP  ribonuclease III activity  DNA binding  deoxyribonuclease I activity  Component cel·lular citoplasma  citosol  Complex de silenciament induït per ARN  growth cone  ARC complex  RISC-loading complex  axó  dendrita  nucli cel·lular  endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment  exosoma extracel·lular  Procés biològic neuron projection morphogenesis  RNA processing  negative regulation of transcription by RNA polymerase II  peripheral nervous system myelin formation  pre-miRNA processing  positive regulation of myelination  nerve development  RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  positive regulation of Schwann cell differentiation  negative regulation of Schwann cell proliferation  production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA  miRNA metabolic process  production of siRNA involved in RNA interference  silenciament gènic  apoptotic DNA fragmentation  negative regulation of tumor necrosis factor production  NIK/NF-kappaB signaling  negative regulation of gene expression  tube formation  Fonts: Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 23405 192119 Ensembl ENSG00000100697 ENSMUSG00000041415 UniProt Q9UPY3 Q8R418 RefSeq (ARNm) NM_001195573 NM_001271282 NM_001291628 NM_030621 NM_177438 NM_148948 RefSeq (proteïna) NP_001182502 NP_001258211 NP_001278557 NP_085124 NP_803187 NP_683750 Localització (UCSC) Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb Cerca a PubMed [4] [5]
Wikidata
Veure/Editar gen humà Veure/Editar gen del ratolí

El nom Dicer fou donat per Emily Bernstein, qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima.

Les enzimes Dicer contenen:

• un domini ATPasa/ARN helicasa a l'extrem N-terminal
• un domini DUF283 de funció desconeguda
• un domini PAZ, responsable del reconeixement dels nucleòtids lliures a l'extrem 3'
• dos dominis catalítics ARNasa III (RIIIa i RIIIb) que constitueixen el centre actiu
• un domini dsRBD (en anglès: double strand RNA binding domain) a l'extrem C-terminal

Cadascun dels dominis ARNasa talla una cadena d'ARN de manera polaritzada: el domini RIIIb talla la cadena ascendent del dsRNA, que conté el 5' fosfat, mentre que el domini RIIIa talla la cadena descendent, que conté l'extrem 3' OH. El domini RIIIa mesura la distància al lloc de tall del dsRNA, potser amb l'ajuda del domini PAZ. Per aquest motiu, el dsRNA es talla a una distància aproximada de 20 parells de bases contades des de l'extrem de la molècula: l'hèlix entre el domini PAZ i el domini RIIIa mesura 65 àngstroms, que corresponen a dues voltes d'hèlix de dsRNA.

1. «Malalties que s'associen genèticament amb Dicer, vegeu/editeu les referències a wikidata».
2. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100697 - Ensembl, May 2017
3. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041415 – Ensembl, May 2017
4. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.