Proteinska podjedinica

Proteinska podjedinica – u In strukturnoj biologiji – je molekula proteina koji se spaja (ili koansamblira) sa ostalim molekulama proteina da formira proteinski kompleks. Neki prirodni proteini imaju relativno mali broj podjedinica i stoga su opisani kao oligomerni, naprimjer hemoglobin ili DNK-polimeraza. Ostale se mogu sastojati od vrlo velikog broja podjedinica pa su opisane kao multimerni ili polimerni, naprimjer mikrotubulski i drugi citoskeletni proteini. Podjedinice multimernog proteina mogu biti identične, homologne ili potpuno različite i posvećene različitim funkcijama.

HLA-A11 sa podjedinicama α (A*1101 genski produkt) i β (Beta-2 mikroglobin). Ovaj receptor ima peptidne veze (u tzv. džepu za vezanje) heterolognog porijekla, koji također doprinosi funkciji.

U nekim proteinskim sklopovima, jedna podjedinica može biti "katalitska podjedinica" koja enzimski katalizira reakciju, dok će "regulacijska podjedinica" olakšati ili inhibirati aktivnost. Iako telomeraza, kao katalitičku podjedinicu ima telomeraznu reverznu transkriptazu, regulaciju ostvaruju faktori izvan proteina.^[1] Enzim sastavljen od regulacijskih i katalitskih podjedinica, kada se sastavi, često se naziva holoenzim. Naprimjer, klasa I fosfoinozitid 3-kinaze sastoji se od katalitske podjedinice p110 i regulacijske podjedinice p85.^[2] Jedna podjedinica je sačinjena od jednog polipeptidnog lanca. Lanac polipeptida ima jedan gen koji ga kodira – što znači da protein mora imati jedan gen za svaku jedinstvenu podjedinicu.

Podjedinica se često označava grčkim ili rimskim slovom, a brojevi ove vrste podjedinice u proteinu označavaju se indeksom. Naprimjer, ATP sintaza ima tip podjedinice koja se naziva α. Tri od njih su prisutne u molekuli ATP sintaze, pa je stoga označena kao α₃. Mogu se odrediti i veće grupe podjedinica, poput α₃β₃ đ-heksamera i c-prstena.

Podjedinične vakcine

Glavni članak: Podjedinična vakcina

Također pogledajte

• Kvaternarna struktura proteina
• Alosterija
• Monomer
• Polimer

Reference

1. Daniel M, Peek GW, Tollefsbol TO (2012). "Regulation of the human catalytic subunit of telomerase (hTERT)". Gene. 498 (2): 135–46. doi:10.1016/j.gene.2012.01.095. PMC 3312932. PMID 22381618.
2. Carpenter CL, Duckworth BC, Auger KR, Cohen B, Schaffhausen BS, Cantley LC (novembar 1990). "Purification and characterization of phosphoinositide 3-kinase from rat liver". J. Biol. Chem. 265 (32): 19704–11. doi:10.1016/S0021-9258(17)45429-9. PMID 2174051.

Dopunska literetura

• Dilip Gore; Reecha Pandit (2011). "In silico Identification of Cell Surface Antigens in Neisseria meningitidis". Biomirror. 2: 1–5.

Vanjski linkovi