C-vrijednost

C-vrednost je marker jednostruke količine DNK u haploidnom jedru (npr. gametu) ili dvostruke količine u diploidnoj somatskoj ćelijieukariotskih organizama. Izražava se u pikogramima (1 pg = e⁻¹² μg). Ponekad se termini C-vrednost i veličina genoma koriste alternativno, iako kod poliploida C-vrednost predstavlja dva genoma, sadržana unutar istog nukleusa.^{[1] [2]}

Procjena C-vrednosti

Relativne molekulske težine nukleotida
^[3]

Nukleotid	Hemijska formula	Relativna molekulska težina
2′-dezoksiadenozin 5′-monofosfat	C10H14N5O6P	331,2213
2′-dezoksitimidin 5′-monofosfat	C10H15N2O8P	322,2079
2′-dezoksiguanozin 5′-monofosfat	C10H14N5O7P	347,2207
2′-dezoksicitidin 5′-monofosfat	C9H14N3O7P	307,1966

Koristeći podatke iz priložene tabele o relativnoj težine nukleotidnih parova, C-vrijednosti ee mogu izračunati prema: A-T = 615,383 i G-C = 616,3711, imajući u vidu da obrazovanje jedne fosfodiesterske veze uzrokuje gubitak jedne H₂O molekule. Nukleotidni fosfati u lancu DNK su kiseli tako da je u fiziološkim uvjetima pH vrednosti, H⁺ ion disociran. Budući da je odnos A-T i G-C parova 1:1, prosječna relativna težina nukleotidnog para je 615,8771.

Relativna molekulska težina se može pretvoriti u apsolutne vrijednosti množenjem jedinicom atomske mase (1 μ), koja je 1/12 mase ¹²C, tj. 1,660539 × 10⁻²⁷ kg. Konsekventno tome, prosečna težina nukleotidnog para je 1,023 × 10⁻⁹ pg, a 1 pg DNK predstavlja 0,978 × 10⁹ baznog para.

Formule za konverziju broja nukleotidnih parova (ili baznih parova) u pikograme DNK i obrnurto su:

veličina genoma (bp) = (0,978 x 10⁹) x DNK sadržaj (pg)

DNK sadržaj (pg) = veličina genoma (bp) / (0,978 x 10⁹)

1 pg = 978 Mb

C-vrijednosti čovjeka

Veličina genoma čovjeka varira; međutim današnje procjene jedarne haploidne veličine zasnivaju se na sekvenciranju Human Genom Project^[4] po kojem genom čovjeka sadrži 3,031.042.417 bp u X gametu i 2,932.228.937 bp u Y gametu. (Veličina genoma X gameta je veća jer je X hromosom veći od Y. Zbirno, veličina XX ženskog diploidnog genoma je veća od muškog XY.)

Sadržaj G-C para kod čovjeka je 41%, tako da je haploidni sadržaj G-C para 40,97460% za X gamete, 41,01724% za Y.

Sumirajući ove brojeve, dolazi se d podataka iz priložene tabele.

Vanjski linkovi

• Animal Genome Size Database(Veličina životinjskog genoma)
• Plant DNA C-values Database (C-vrednosti biljnih DNK)
• Fungal Genome Size Database (veličina genoma gljiva)