Metagenomica
Uit Wikipedia, de vrije encyclopedia
Metagenomica (Engels: metagenomics) is het onderzoeksgebied dat zich bezighoudt met de analyse van het genetisch materiaal dat rechtstreeks uit een bepaalde omgeving wordt bemonsterd. Men kan door middel van metagenomisch onderzoek te weten komen welke micro-organismen er in een bepaalde omgeving leven, wat hun soortenrijkdom is en welke mogelijke functie ze vervullen.[1]
Tijdens een metagenomisch onderzoek wordt eerst een monster genomen van een bepaalde omgeving, zoals de bodem, het zeewater of de menselijke darm. In dit monster bevindt zich genetisch materiaal (DNA) van alle plaatselijke micro-organismen. Het DNA wordt geïsoleerd uit het monster, vervolgens gekloneerd (vermeerderd), en ten slotte met moderne apparatuur gesequencet. Met de computer kunnen dan alle individuele genomen die in het monster zaten geprofileerd worden.[2]
De metagenomica heeft licht geworpen op de gigantische diversiteit van het microbiële leven om ons heen.[3] In het verleden was het nodig de microbiële soorten eerst te isoleren en in cultuur te brengen, alvorens ze te sequencen. Doordat de DNA-sequencers vanaf de jaren 2000 in hoog tempo gevoeliger en geavanceerder werden, werd het mogelijk hele microbiële gemeenschappen direct uit hun lokale omgeving in ongeëvenaard detail te onderzoeken.[2]