清水隧道是位於臺灣花蓮縣秀林鄉的兩座單線鐵路隧道，屬於北迴線鐵路和仁車站＝崇德車站區間，第一代隧道通車於1979年2月，並於1993年—2001年期間，配合北迴鐵路雙線電氣化工程，於清水隧道西側新鑿新清水隧道（第二代隧道），2001年9月左右通車。