新疆自然博物馆（全称为中国科学院新疆生态与地理研究所新疆自然博物馆）位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市北京南路科学二街277号，是新疆境内关于生态学、地理学、生物学等自然科学的规模最大且内容最为丰富的博物馆。也是中国为数不多讲述内陆荒漠干旱区的科普场馆。其前身为中科院新疆生态与地理研究所标本馆。2022年，新疆自然博物馆被列为新疆维吾尔自治区特色博物馆。