埃德蒙頓龍屬於鴨嘴龍亞科,但其演化位置仍未確定。早期的系統發生學研究大多將埃德蒙頓龍與鴨龍,共同歸類於鴨嘴龍亞科的眾多演化支之一,例如理查·史旺·魯爾( Richard Swann Lull)與尼爾達·萊特(Nelda Wright)在1942年提出的北美洲鴨嘴龍科專題論文。在90年代,科學家採用親緣分支分類法研究埃德蒙頓
Lambe)在1917年建立埃德蒙頓龍屬,以命名在亞伯達省的埃德蒙頓組下層(現在的馬蹄峽谷組)發現的化石。鴨嘴龍科的系統呈混亂狀態,直到1942年理查·史旺·魯爾( Richard Swann Lull)與尼爾達·萊特(Nelda Wright)提出鴨龍屬,將數個疑名歸類於鴨龍。科普在美國自然歷史博物館的架設化石改名為科氏鴨龍(Anatosaurus