Coagulin

腸。在小腸萌發後，凝結芽孢桿菌會分泌乳酸與短鏈脂肪酸，進而影響腸道菌叢的組成，還可以分泌細菌素（英语：Bacteriocin）、凝固素（英语：Coagulin）等毒素以抑制致命的細菌生長。凝結芽孢桿菌屬於暫駐菌，在腸道內停留的時間不長，約七天後其內孢子便會隨糞便排出體外。

首先活化蛋白酶鱟因子C，使其可以切除抑制單元，從而活化同樣為蛋白酶的鱟因子B。鱟因子B進而活化鱟凝血酶，而鱟凝血酶會部分消秏凝固蛋白原（英语：coagulin），生成會自動聚合成凝膠的凝固蛋白。(1,3)-β-D-葡聚糖導致凝結的通路稍有不同，是通過鱟因子G活化鱟凝血酶。