1970年6月，輔政司署銓敍科成立，首長為銓敍司，取代原輔政司署人事組，負責管理公務員一切事宜。[1]於1970年代，據當時的輔政司羅弼時呈交予英國的機密文件中顯示，銓敍司為一敏感職位，應由英國人出任。[2]儘管1987年已有香港出生，印度裔的高禮和就任，但直至1993年前所有銓敍司皆非華人，屬最遲一批有華人首長的政府部門。1991年，銓敍科改稱公務員事務科，首長為公務員事務司。1997年回歸後，公務員事務科改稱公務員事務局。
2002年，行政長官董建華推行主要官員問責制，將所有局長由公務員職位改為政治委任。但為平息公務員疑慮，規定公務員事務局局長須由公務員轉任；而且委任期滿後可返回公務員崗位[3]（即俗稱「旋轉門」）。而公務員事務局不設副局長及局長政治助理的職位，亦是唯一有此安排的決策局。
2020年，聶德權以非公務員的身份獲委任為公務員事務局局長，被指違反政府與公務員的協定。
