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蛋白质亚基(英语:Protein subunit)又称蛋白质次单元、蛋白亚基,在结构生物学中是指一条多肽链或单个蛋白分子,其与别的蛋白组装(或“共组”)以形成蛋白复合体[1][2][3]。蛋白亚基属于组成具完整结构或功能蛋白质的一部分,其为相对独立的“结构域”、“结构片段”或“次级结构单位”;亚基也是蛋白质的最小共价单位,具有完整的三级结构[4]。蛋白质的大型装配体(如病毒)往往只使用少量类型的蛋白亚基作为构建单元[5]。
一些天然存在的蛋白质具有相对少量的亚基,因此被描述为寡聚体,例如血红蛋白或DNA聚合酶。其他蛋白可能由非常多的亚基组成,因此被描述为多聚体,例如微管和其他细胞骨架蛋白。多聚体蛋白质的亚基可以是相同,同源或完全不同的(每个亚基行使不同的功能)。
在一些蛋白质复合物中,一个亚基可以是酶催化反应的“催化亚基”,另一条“调节亚基”将促进或抑制此催化活性。尽管端粒酶以端粒酶逆转录酶作为催化亚基,但调节却由蛋白质以外的因子完成。组装时由调节亚基和催化亚基组成的酶通常称为全酶。例如,PI3K激酶由p110催化亚基和p85调节亚基组成。
一个亚基由一条多肽链组成;一条多肽链具有一个编码它的基因,这意味着一个蛋白质的每个独特的亚基都必须具有一个基因对应之。
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