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此條目介紹的是植物界中以「绿藻门」为正式名称的分类阶元。关于「绿藻」的其它含义，请见「绿藻」。綠藻門（学名：Chlorophyta）是植物中的一門[4]，包含有約8000個物種[5][6]，大部份都是水生光合真核生物。和陸生植物 （苔蘚植物和維管植物）一樣，綠藻也含有葉綠素 a 和 b ，且將能源轉化為澱粉存在其色素體內。[5]綠藻門和輪藻門與有胚植物相關，一起合稱為绿色植物。
此門包含單細胞和多細胞的物種。大部份物種生活在淡水裡，其他許多物種則居住在海水中，另外還有一些物種適應了許多的環境，如雪藻居住在夏天的高山雪原中。其他還有依附在岩石或樹木上頭的。一些地衣和真菌與綠藻有共生關係，綠藻門中的藻類也會和原生動物、海綿及刺胞動物等形成共生關係。有些會有鞭毛而利於移動，有些會行同配生殖或異配生殖等有性生殖。
根據 Guiry & Guiry (2020)的AlgaeBase數據庫紀錄，本門之下分類單元如下[4]：
- 綠藻亞門（Chlorophytina Cavalier-Smith）[7]
- 四爿藻纲（Chlorodendrophyceae Massjuk）
- 绿藻纲（Chlorophyceae Wille）
- 平藻纲（Pedinophyceae Moestrup）
- 共球藻纲（Trebouxiophyceae Friedl）
- 石莼纲（Ulvophyceae K.R.Mattox & K.D.Stewart ）：原羽藻綱（Bryopsidophyceae，只有羽藻目一個成員）併入至此。
- Chlorophyta classis incertae sedis
- Chloropicophyceae Lopes dos Santos & Eikrem
- 綠色鞭毛藻亞門 Prasinophytina Round：或作绿枝藻亚门
- 小豆藻纲（Mamiellophyceae Marin & Melkonian）
- Nephrophyceae Cavalier-Smith
- 塔胞藻纲（Pyramimonadophyceae）
- 肾爿藻纲（Nephroselmidophyceae）
- 掌叶藻纲（Palmophyllophyceae Leliaert et al.）
- 尘囊藻纲 Picocystophyceae Eikrem & Lopes dos Santos
- 假心胞藻纲（Pseudoscourfieldiophyceae）
- 地位未定类群：
- 本门包括以下纲：
- 四爿藻纲 Chlorodendrophyceae Massjuk
- 绿藻纲 Chlorophyceae Wille
- 四爿藻纲 Chloropicophyceae
- 小豆藻纲 Mamiellophyceae Marin & Melkonian
- 肾爿藻纲 Nephroselmidophyceae
- 掌叶藻纲 Palmophyllophyceae Leliaert et al.
- 平藻纲 Pedinophyceae Moestrup
- 尘囊藻纲 Picocystophyceae Eikrem & Lopes dos Santos
- Pleurastrophyceae
- 绿色鞭毛藻纲 Prasinophyceae
- 塔胞藻纲 Pyramimonadophyceae
- 共球藻纲 Trebouxiophyceae Friedl
- 石蓴綱 Ulvophyceae K.R.Mattox & K.D.Stewart，石莼纲
- 纲的地位未定的目：
- Marsupiomonadales
- 纲、目的地位未定的科：
- Distomataceae
- Monostysisyrinaceae
- 纲、目和科的地位未定的属：
- Actionoporella
- Anthracochondrus Kušta, 1898
- Antrosphaera Sarjeant, 1961
- Apiroschadon Loeblich & Tappan, 1976
- Asphaltinella B.Mamet & A.Roux, 1978
- Bion Lohmann
- Bogutschanophycus Korde
- Bombycina Örsted, 1844
- Calathella R.Florin, 1929
- Chlorodendron Skvortzov, 1959
- Colonella
- Dasyhapsis A.R.Loeblich Jr. & E.R.Wicander, 1976
- Dasyphapsis A.R.Loeblich Jr. & E.R.Wicander, 1976
- Dictyodiscus Playford & Wicander, 1988
- Diploglossa C.J.E.Morren
- Gambangia I.C.Cookson & A.Eisenack, 1979
- Hemiruptia Ottone, 1996
- Heterocystinella I.C.Cookson & A.Eisenack, 1979
- Hysginum M.Perty, 1852
- Jansaella B.L.Mamet & A.Roux, 1975
- Johnson Eiseman & Earle
- Klebsormidium
- Lanceoforma Walter et al., 1976
- Mawsonella F.Chapman, 1927
- Merrettia S.F.Gray, 1821
- Microfasta Morgan, 1975
- Nesea Lamouroux
- Palaeomastigocladus Misra & Kumar, 1988
- Paramastix
- Pechengia A.Y.Rozanov & M.M.Astafieva, 2008
- Peltacystia B.E.Balme & K.L.Segroves, 1966
- Phaeostrepte Skuja ex T.Willén, 1992
- Physophycus W.P.Schimper, 1869
- Piriurella I.C.Cookson & A.Eisenack, 1979
- Protonema C.Agardh
- Pseudomurilella N.Hanagata, 1998
- Pseudopalaeoporella Buggisch & Fluegel, 1992
- Pteroverricatus T.K.Al-Ameri, 1984
- Ptilotoscolus A.R.Loeblich Jr. & E.R.Wicander, 1976
- Quadratimorpha Xing & Liu, 1973
- Radiosphaeroporella
- Retialetes S.C.D.Sah & S.K.Dutta, 1966
- Saharifusa E.D.Pöthe de Baldis, 1997
- Schizosporis I.C.Cookson & M.E.Dettmann, 1959
- Schodackia R.Ruedemann, 1942
- Sgrossoella P.de Castro, 1969
- Sinophyllum Wu, 1991
- Sphaerodesmus Corda
- Sphaeroporella Wu, 1991
- Sphaerosiphon Schussnig, 1915
- Spheroporella Antropov, 1967
- Sporangites J.W.Dawson, 1863
- Springerella O.Dragastan & D.K.Richter, 2001
- Thrypticosphaera W.A.S.Sarjeant, 1987
- Vesicularius Roussel
- Wendiella Timofeev, 1962
- Yuknessia C.D.Walcott, 1919
- Zygoxanthium Ehrenberg
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绿藻的繁殖方式多样，有无性生殖、有性生殖，又因单细胞植物体、多细胞植物体、生殖结构是否被营养结构包被而有不同；还具有接合生殖等特有的生殖方式。
一些单细胞绿藻既能进行无性生殖，也能进行有性生殖，衣藻属是其典型代表。无性生殖时，单倍体核行有丝分裂，在细胞壁内产生最多16个子细胞。然后每个子细胞各自的细胞壁和鞭毛，并分泌一种分解亲代细胞壁的酶，这些子细胞——游动孢子释放出来，各自发育成新个体。有性生殖时，衣藻的营养细胞在缺氮条件下形成配子，配子相互结合，形成二倍体的受精卵。受精卵周围形成厚厚的细胞壁，经过一段时间的休眠后，受精卵进行减数分裂，产生四个单倍体细胞，这些细胞可以进行分裂或相互交配以产生新的受精卵。[10]:348-349
石莼属是多细胞植物，藻体叶片状，石莼属的营养结构和生殖结构没有绝对的界限，除基部及固着器以外，孢子体每个细胞均可形成孢子囊，其内的细胞核进行减数分裂，产生多个单倍体的具有4条鞭毛的游动孢子。游动孢子释放出来后，可以萌发产生单倍体的配子体。除基部及固着器以外，配子体成熟时，每个细胞均可形成配子囊，经有丝分裂产生多个游动配子（+配子和－配子同型），配子结合后形成合子，合子萌发产生孢子体。石莼属的孢子体和配子体形态上区别不大。[10]:351-353
接合生殖是水绵属特有的生殖方式，进行时藻体变为黄绿色，有以下类型：
- 梯形接合：两条水绵并排靠近，相邻处每个细胞各产生一个突起，伸长并融合成数条通道，称为接合管。同时两个相邻水绵单个细胞的细胞质与细胞核分别浓缩成两个配子，一条水绵的单个细胞中的雄配子做变形虫式运动，通过接合管到达另一条水绵的单个细胞内，与雌配子融合，形成一个合子，其他细胞亦然。结束后，一条水绵体内细胞全空，而另一条水绵体内每个细胞各含有一个合子。由于接合过程的形态像一架整齐的梯子，故该类型称为梯形接合。
- 侧面接合：一条水绵上相邻的两个细胞各产生一个突起，伸长并融合成一条接合管于水绵体一侧。剩余过程同第一种类型，最后形成合子。结束后，一个细胞变空，另一细胞内有一合子。由于该类型于水绵体一侧进行，故称为侧面接合。[10]:355-356
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