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结构式（英語：Structural Formula）是用表示分子結構的圖示表示方式，可以表示在真實三維空間下，原子可能的組合方式。分子中的化學鍵可能會明確的呈現，也可能用較不直接的方式呈現。结构式和其他的化学式不同[a]，大多數的化学式使用的符號有限，可以說明分子結構的程度也有限，而结构式可以更完整的說明分子的幾何結構。例如，許多化合物存在同分異構物，也就是有不同結構但相同分子式的化合物。用結構式即可說明其差異。畫結構式的方式有許多種，例如路易斯結構、结构简式、键线式、纽曼式、环己烷构象、哈沃斯投影式及费歇尔投影式等[2]。
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在化学数据库中有許多針對化合物的系統化命名格式，這些格式可以等價成幾何結構。這些化合物命名系統包括有简化分子线性输入规范（SMILES）、国际化合物标识（InChI）及化学标记语言（CML）。這些系統化的名稱可以和結構式相互轉換。不過化學家在描述化學反應或是化學合成時，幾乎都使用其結構式，而不是其名稱，因為結構式可以讓化學家視覺化分子，以及在化學反應中的結構變化。ACD/ChemSketch及ChemDraw是常用來繪製反應以及結構式的軟體，多半是以路易斯結構表示。
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