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杂原子是指有機化合物中,除了碳和氢以外的其他原子。一般指在分子骨架(特别是环系)中替换碳的原子。氮、氧、硫、磷、硼、氯、溴、碘等都是常见的杂原子。[1][2]。若有機化合物中有包括杂原子的環,稱為杂环化合物。
在描述蛋白質結構時,特別在蛋白質資料庫中,雜原子的欄位(HETATM)是描述不屬於生物聚合物的一些小分子中的原子[3]。
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