下表列出新疆自1911年起历任行政长官：
中华民国时期
- 新疆都督：
- 附：阿尔泰办事长官
- 帕勒塔 1912年5月17日－1914年1月9日
- 刘长炳（暂署）1914年1月9日－1915年11月
- 程克 1915年12月3日－1918年3月15日
- 张庆桐（署）1918年3月15日－1924年7月31日
- 新疆督军
- 新疆民政长
- 新疆巡按使
- 新疆省长
- 楊增新 1914年6月30日－1928年7月7日
- 新疆省政府主席
- 总统穆罕默德·尼牙孜·艾来木 1933年2月20日－1934年6月
- 总理沙比提大毛拉 1933年2月20日－1934年6月
- 埃米尔穆罕默德·伊敏 1933年2月20日－1934年6月
- 主席艾力汗·吐烈 1944年－1946年
中华人民共和国
新疆省临时政府主席 → 新疆省人民政府主席
- 包尔汉·沙希迪 1949年10月－1955年1月
- 赛福鼎·艾则孜 1955年10月－1967年1月
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