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文昌魚目(學名:Amphixiformes),亦作昌魚目或蛞蝓魚目,是头索动物亞门头索纲之下唯一的一個目,包括有多個科。遍布於溫帶浅海海域[3]及熱帶的沙海床。现存有物種約22個種。
文昌魚與魚類具有許多共同特徵,如脊索、神經索、鰓裂、肛門後尾部、肝門脈系統、內柱(與甲狀腺同源)等,但不具有魚類之脊椎骨、軟骨或其他骨骼構造,亦無明顯之頭部,所以不是魚類,文昌魚分類上屬於脊索動物門之頭索動物亞門,魚類則屬於脊椎動物亞門。
本目的分類,不同的作者有不同的見解[5]。 文昌魚目之下原來只有鰓口科一個科,包括文昌鱼属及偏文昌鱼属兩個屬[6]。但由於文昌鱼属及偏文昌鱼属兩者在解剖結構上顯着不同,所以現時被劃分成為兩個不同的科,而偏文昌魚屬又再細分為兩個屬。現時最常見的分類如下:
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