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Y RNA係一種短非編碼RNA。它是Ro60核糖核蛋白顆粒的組分之一[1]。在全身性紅斑狼瘡患者體內,它是患者自身抗體的攻擊目標之一[2]。Y RNA對DNA複製來說至關重要,因爲它們能與染色質和起始點識別複合物相互作用[3][4]。
推測Y RNA的5'和3'端會摺疊形成一個保守的莖形結構。已確認Y RNA有一個單胞嘧啶(C)突出,這個突出對Y RNA與Ro蛋白的結合至關重要[5][6][7]。
目前,已知Y RNA有兩大功能:一,抑制Ro60;二,作爲DNA複製的一種起始因子。失去了保守的與Ro60蛋白的結合位點的突變人類Y RNA仍然能參與DNA複製[3],這說明與Ro蛋白結合以及啓動DNA複製是Y RNA的兩種互不相干的功能。儘管Y RNA的衍生小型RNA大小與微RNA相當,但是它們卻和微RNA在功能上卻毫無關係[8]。
在自由狀態下,Ro蛋白質會與一系列的摺疊錯誤的RNA結合,比如摺疊錯誤的5SrRNA,這被認爲是(RNA)品質控制機制的一種[9]。與Y RNA或另外的RNA結合的Ro複合物的晶體結構顯示,Ro蛋白質與單鏈RNA的3'端的結合特異性相對較低。但Y RNA與Ro蛋白質還會在另一位點發生特異性結合,且該結合能調控Ro複合物與其他RNA的結合[5]。在Deinococcus中,自由狀態下的Ro蛋白亦與參與23SrRNA的成熟過程[10]。在該物種中,造成Y RNA缺失的突變並不致死,Y RNA在不與Ro蛋白結合時會不穩定[10]。
人類的Y RNA對DNA複製是不可或缺的[3]。通過生物化學上的分離和重構實驗,人們已證明,在體外培養(in vitro)的脊椎動物細胞的核中,Y RNA對染色體DNA的複製是必不可少的[3]。如果對體外細胞或體內(in vivo)細胞中的Y RNA進行特異性降解的話,那麼DNA複製會被抑制[3]。科學家認爲Y RNA通過作同時與染色質和與複製啓動相關的蛋白(包括起始識別複合體)結合的中間體發揮作用[4]。
Y RNA在一些人類腫瘤中處於過度表達狀態,且爲細胞增殖所必需[11]。Y染色體的與微RNA大小相近的小型分解產物可能與自體免疫病等病症有關[12]。
已在真核細胞與細菌中發現了被推定爲Y RNA和Ro蛋白質的物質[6][13]。人類應有4種Y RNA,分別是hY1、hY3、hY4,以及hY5[13]。另外,人體內也有很多與Y RNA相關的假基因。秀麗隱桿線蟲(C. elegans)則有1種Y RNA,名爲CeY RNA。該生物體內許多sbRNA也被認爲可能與Y RNA同源[14][15]。抗輻射奇異球菌(Deinococcus radiodurans)編碼一種與Ro蛋白同源的蛋白質,名爲rsr(Ro sixty related,意爲第六個與Ro有關的)。用UV燈對該菌進行照射,可以誘導編碼rsr的基因的表達。在該情況下,抗輻射奇異球菌的菌體內至少會出現4種短RNA,其中一種RNA似乎與Y RNA具有同源性[16]。
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