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鹿城褐家鼠冠状病毒(Lucheng Rn rat coronavirus、LRNV)是甲型冠狀病毒屬的一種病毒,於2015年在中國浙江溫州鹿城區的褐家鼠中發現,是繼1949年發現的鼠冠狀病毒之後,第二種在鼠類中發現的冠狀病毒[1][2]。
鹿城褐家鼠冠状病毒的基因組約長28800nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有NS2、NS4、NS7a、NS7b、NS8a與NS9等五個開放閱讀框編碼輔助蛋白,其基因順序為1ab-NS2-S-NS4-E-M-NS7a-NS7b-N-NS8a-NS9,其中NS7a與NS7b位於膜蛋白與衣殼蛋白的基因中間,為此病毒所獨有,不見於甲型冠狀病毒屬的其他病毒。另外此病毒衣殼蛋白的序列與同屬的其他病毒相似度較低,反而與乙型冠狀病毒屬病毒的相似度較高,可能是曾與乙型冠狀病毒屬病毒發生重組的結果[1]。
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