已測序的生物
维基媒体列表条目 / 維基百科,自由的 encyclopedia
已測序的生物指其基因組已經被完全測序的生物。其中部分生物的DNA序列已經被完全註釋,功能性的片段(如基因等)已作圖。
此條目翻譯品質不佳。 (2016年3月21日) |
借助於基因組研究及高通量處理等技術,越來越多的生物的全部基因被人們獲得。自從1995年以來已經有150個基因組被解密,將近每個星期有新的物種添加進來。
已測序的生物列表
下表是目前爲止已經被相當完全測序的生物。
- Agrobacterium tumefaciens - Pflanzenpathogen(德语:pathogen)es Bakterium, tumorbildend
- Aquifex aeolicus - Hyperthermophiles Meeresbakterium
- Bacillus anthracis - Anthrax-Erreger
- Bacillus cereus - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Bacillus halodurans - Enzymproduzierendes Bakterium(Industriell genutzt)
- Bacillus subtilis - Enzymproduzierendes Bakterium(Industriell genutzt)
- Bacteroides thetaiotaomicron - Darmbakterium
- Bifidobacterium longum - Darmbakterium
- Blochmannia floridanus - Bakterium in Symbiose mit Ernteameisen(德语:Ernteameisen)
- Bordetella bronchiseptica(德语:Bordetella bronchiseptica) - Erreger chronischer Infektionen der Atemwege
- Bordetella parapertussis(德语:Bordetella parapertussis) - Erreger von mildem Keuchhusten
- Bordetella pertussis - Erreger von Keuchhusten
- Borrelia burgdorferi - Borreliose(德语:Borreliose)-Erreger
- Bradyrhizobium japonicum - Knöllchenbakterium der Sojabohne
- Brucella melitensis(德语:Brucella melitensis) - Erreger des Maltafiebers
- Brucella suis - potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend
- Buchnera aphidicola - Bakterium in Symbiose mit Blattläusen
- Burkholderia mallei - Erreger des Rotz(德语:Rotz)es bei Huftieren, auch humanpathogen(Einsatz als Biowaffe)
- Burkholderia pseudomallei - Erreger der Melioidose, vor allem in Südostasien
- Campylobacter jejuni - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Caulobacter crescentus - Süßwasserbakterium
- Chlamydia muridarum - Atemwegsinfektionen bei Maus und Meerschweinchen
- Chlamydophila caviae - Augenentzündungen bei Meerschweinchen
- Chlamydia trachomatis - Erreger der Harnröhrenentzündung
- Chlamydophila pneumoniae(德语:Chlamydophila pneumoniae) - Erreger einer Bronchitis
- Chlorobium tepidum - Grünes Schwefelbakterium
- Chromobacterium violaceum - humanpathogenes Bakterium(Diarrhoe und andere Erkrankungen)
- Clostridium acetobutylicum - Aceton- und Butanol-produzierendes Bakterium
- Clostridium perfringens - Erreger Diarrhoe etc.
- Clostridium tetani - Tetanus-Erreger
- Corynebacterium diphtheriae(德语:Corynebacterium diphtheriae) - Erreger der Diphtherie
- Corynebacterium jeikeium(英语:Corynebacterium jeikeium) - nosokomial pathogener Hautbewohner
- Corynebacterium efficiens - Bakterium zur Produktion von Aminosäuren u. a.
- Coxiella burnetti(英语:Coxiella burnetti) - Erreger des Q-Fieber
- Deinococcus radiodurans - extrem strahlungstolerantes Bakterium
- Desulfotalea psychrophila - extrem kältetolerantes Bakterium des arktischen Eismeer(德语:Eismeer)es
- Desulfovibrio vulgaris - Bakterium aus Ölfeldern, wirtschaftlicher Schädling
- Enterococcus faecalis(德语:Enterococcus faecalis) - Darmbakterium(德语:Darmbakterien), Modellorganismus
- Escherichia coli - Darmbakterium(德语:Darmbakterien), Modellorganismus
- Fusobacterium nucleatum - Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag
- Haemophilus ducreyi - Erreger des Schanker(德语:Schanker)
- Haemophilus influenzae - Erreger einer Erkältung
- Helicobacter hepaticus - Erreger chronischer Hepatis und von Lebergeschwüren bei Mäusen.
- Helicobacter pylori - Erreger von Magengeschwüren
- Lactobacillus plantarum(英语:Lactobacillus plantarum) - Milchsäurebakterium
- Lactococcus lactis - Käsebakterium
- Legionella pneumophila - Erreger der Legionärskrankheit
- Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium
- Leptospira interrogans - Erreger der Leptospirosis
- Listeria innocua - nicht pathogene Listeria-Art
- Listeria monocytogenes - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
- Mannheimia succiniciproducens - symbiotisches Bakterium im Magen von Kühen
- Mesoplasma florum - Bakterium mit extrem kleinen Genom
- Mesorhizobium loti - Knöllchenbakterium bei Lotus-Arten
- Mycobacterium leprae - Erreger der Lepra
- Mycobacterium bovis(德语:Mycobacterium bovis) - Erreger der Rindertuberkulose(德语:Rindertuberkulose)
- Mycobacterium paratuberculosis(德语:Mycobacterium paratuberculosis) - Erreger der Rinderkrankheit Johne's Desease
- Mycobacterium tuberculosis - Erreger der Tuberkulose
- Mycoplasma gallisepticum - Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung bei Geflügel
- Mycoplasma genitalium - Erreger von Infektionen des Genitaltraktes
- Mycoplasma penetrans - Erreger von Entzündungen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus(AIDS)
- Mycoplasma pneumoniae - Erreger einer Bronchitis
- Mycoplasma pulmonis - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege bei Mäusen
- Neisseria meningitidis - Erreger der Meningitis(Hirnhautentzündung)
- Nitrisomonas europaea - Nitratbakterium
- Oceanobacillus iheyensis - Tiefseebakterium
- Pasteurella multocida(德语:Pasteurella multocida) - Erreger von Vogelcholera, Ansteckender Kaninchenschnupfen, Hämorrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei Schweinen und Menschen u.a.
- Photorabdus luminescens - Bakterium in Symbiose mit insektenpathogen(德语:pathogen)en Fadenwürmern
- Porphyromonas gingivalis(英语:Porphyromonas gingivalis) - Erreger von Parodontose
- Prochlorococcus marinus(德语:Prochlorococcus marinus) - Meeresbakterium
- Pseudomonas aeruginosa - als Opportunist(德语:Opportunist) bei geschwächtem Immunsystem pathogen
- Pseudomonas putida - Bodenbakterium zum Abbau von Verseuchung(德语:Verseuchung)en
- Pseudomonas syringae - Pflanzenpathogenes Bakterium, u. a. Tomatenschädling
- Ralstonia solanacearum - Pflanzenpathogenes Bakterium, Welke(德语:Welke) bei Hunderten verschiedener Pflanzenarten
- Rhodopirellula baltica - Rotes Meeresbakterium
- Rhodopseudomonas palustris - Purpurbakterium
- Rickettsia conorii - Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber
- Rickettsia prowazekii - Erreger des Typhus
- Rickettsia sibirica - Erreger von Zeckenfieber in Nordasien
- Rickettsia typhi - Erreger des Mäusetyphus(auch humanpathogen)
- Salmonella typhi(英语:Salmonella typhi) - Erreger des Typhusfieber
- Salmonella typhimurium(德语:Salmonella typhimurium) - Erreger des Typhusfieber bei der Maus
- Shewanella oneidensis - Metallabbauendes Bodenbakterium
- Shigella flexneria - evtl. Ursache von Plötzlichem Kindstod
- Sinorhizobium meliloti(英语:Sinorhizobium meliloti) - Knöllchenbakterium des Alfalfa(德语:Alfalfa)
- Staphylococcus aureus - Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks
- Staphylococcus epidermidis - Hautbakterium, pathogen bei Wunden
- Streptococcus agalactiae(德语:Streptococcus agalactiae) - Erreger von schweren Neugeborene(德语:Neugeborene)ninfektionen, Meningitis u. a.
- Streptococcus mutans(德语:Streptococcus mutans) - Erreger von Karies
- Streptococcus pneumoniae - Erreger von Lungenentzündungen, Menigitis und Blutvergiftung(德语:Blutvergiftung)en
- Streptococcus pyogenes - Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks u. a.
- Streptomyces avermitilis(英语:Streptomyces avermitilis) - Antibiotikaproduzierendes Bakterium(industriell genutzt)
- Streptomyces coelicolor(德语:Streptomyces coelicolor) - Antibiotikaproduzierendes Bakterium(industriell genutzt)
- Thermoanaerobacter tengcongensis - Bakterium aus heißen Quellen in Volksrepublik China
- Thermotoga maritima - sehr säureliebendes Bakterium, reinigt Bergwerkshalden u. a.
- Thermus thermophilus - hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz in der PCR und anderswo.
- Treponema pallidum - Erreger der Syphilis
- Tropheryma whippley - Erreger der Whipple-Krankheit(德语:Whipple-Krankheit)
- Ureaplasma urealyticum - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes
- Vibrio cholerae - Erreger der Cholera
- Vibrio fischeri - Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die Qualitätsbestimmung von Abwasser verwendet wird
- Vibrio parahaemolyticus - Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen
- Vibrio vulnificus - Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr von rohen Meeresorganismen führen.
- Wigglesworthia glossinidia - Erreger der Schlafkrankheit(德语:Schlafkrankheit)
- Wolinella succinogenes - Bakterium im Kuhmagen
- Xanthomonas axonopodis - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Zitronenkrebs bei Zitrusfrüchten
- Xanthomonas campestris - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Schwarzfäule bei Kreuzblütern
- Xylella fastidiosa - Pflanzenpathogenes Bakterium, schwerer Schädling in Obst-, Nuss(德语:Nuss)- und Kaffee-Plantagen in Nord- und Südamerika
- Yersinia pestis - Erreger der Pest
- Anabaena spec. - Fadenblaualge
- Gloeobacter violaceus - primitive Blaualge
- Synechococcus spec. - Meeres-Blaualge
- Synechocystis spec. - Meeres-Blaualge
- Thermosynechococcus elongatus - Thermophile Blaualge
原生生物
- Leishmania infantum - 一種利什曼原蟲
- Leishmania major - 一種利什曼原蟲
- Plasmodium falciparum - 惡性瘧原蟲
- Plasmodium yoelii yoelii - 約氏瘧原蟲,引起嚙齒動物瘧疾
- Thalassiosira pseudonana - 一種海洋硅藻
- Trypanosoma brucei - 一種錐體蟲
- Trypanosoma congolense - 一種錐體蟲
- Trypanosoma cruci - 一種錐體蟲
- Trypanosoma vivax - 一種錐體蟲
真菌
- Ashbya gossypii - 感染柑橘類和棉花的真菌
- Aspergillus fumigatus - 煙麴黴,人類致病菌
- Aspergillus nidulans - 構巢麴黴
- Debaryomyces hansenii - 耐鹽的酵母
- Encephalitozoon cuniculi - 一種單細胞微孢子蟲
- Kluyveromyces lactis - 具有潛在藥用生産價值的酵母
- Kluyveromyces waltii - 一種酵母
- Magnaporthe grisea - 稻熱病菌
- Neurospora crassa - 粗糙脈孢菌,橙色的麫包黴,模式生物
- Phanerochaete chrysosporium - 白腐病病菌
- Saccharomyces cerevisiae - 釀酒酵母,模式生物
- Schizosaccharomyces pombe - 粟酒裂殖酵母
- Trichoderma reesei = Hypocrea jecorina - 一種木黴
- Yarrowia lipolytica - 一種酵母
- Candida albicans - 白色唸珠菌,人類致病菌
植物
- 物种 基因组大小和开放阅读框 文献
Sesamum indicum L. Sesame芝麻(2n = 26) 293.7 Mb, 10,656 orfs 1
Oryza brachyantha短药野生稻 261 Mb, 32,038 orfs 2
Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻 105 Mb, 9,606 orfs 3
Pyropia yezoensis susabi-nori海苔 43 Mb, 10,327 orfs 4
Prunus persica Peach桃 226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5
Aegilops tauschii山羊草(DD) 4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6
Triticum urartu乌拉尔图小麦(AA) 4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7
moso bamboo (Phyllostachys heterocycla)毛竹 2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8
Cicer arietinum Chickpea 鹰嘴豆 ~738-Mb,28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740 Mb), 27,571 orfs 10
Prunus mume梅 280 Mb, 31,390 orfs 11
Gossypium hirsutum L.陆地棉 2.425 Gb 12
Gossypium hirsutum L.雷蒙德氏棉 761.8 Mb 13
Citrus sinensis甜橙 87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14
甜橙 367 Mb 15
Citrullus lanatus watermelon西瓜 353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16
Betula nana dwarf birch,矮桦 450 Mb 17
Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻(产油藻类之一) 28.7 Mb,11,973 orfs 18
Triticum aestivum bread wheat普通小麦 17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19
Hordeum vulgare L. barley大麦 1.13 Gb of 5.1 Gb,26,159 high confidence orfs,53,000 low confidence orfs 20
Gossypium raimondii cotton雷蒙德氏棉 D subgenome,88% of 880 Mb 40,976 orfs 21
Linum usitatissimum flax亚麻 302 mb (81%), 43,384 orfs 22
Musa acuminata banana香蕉 472.2 of 523 Mb, 36,542 orfs 23
Cucumis melo L. melon甜瓜 375 Mb(83.3%)27,427 orfs 24
Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli梨(砀山酥梨) 512.0 Mb (97.1%), 42,812 orfs 25,26
Solanum lycopersicum番茄 760/900 Mb,34727 orfs 27
S. pimpinellifolium LA1589野生番茄 739 Mb
Setaria狗尾草属(谷子、青狗尾草) 400 Mb,25000-29000 orfs 28,29
Cajanus cajan pigeonpea木豆 833 Mb,48,680 orfs 30
Nannochloropis gaditana一种海藻 ~29 Mb, 9,052 orfs 31
Medicago truncatula蒺藜苜蓿 350.2 Mb, 62,388 orfs 32
Brassica rapa白菜 485 Mb 33
Solanum tuberosum马铃薯(DM) 725 Mb,39031 orfs 34
Thellungiella parvula条叶蓝芥 13.08 Mb 29,338 orfs 35
Arabidopsis lyrata lyrata玉山筷子芥? 183.7 Mb, 32670 orfs 36
Fragaria vesca野草莓 240 Mb,34,809 orfs 37
Theobroma cacao可可 76% of 430 Mb, 28,798 orfs 38
Aureococcus anophagefferens褐潮藻 32 Mb, 11501 orfs 39
Selaginella moellendorfii江南卷柏 208.5 Mb, 34782 orfs 40
Jatropha curcas Palawan麻疯树 285.9 Mb, 40929 orfs 41
Oryza glaberrima光稃稻(非洲栽培稻) 206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs(>70% coverage) 42
Phoenix dactylifera棕枣 380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs 43
Chlorella sp. NC64A小球藻属 40000 Kb, 9791 orfs 44
Ricinus communis蓖麻 325 Mb, 31,237 orfs 45
Malus domestica (Malus x domestica) 苹果 742.3 Mb 46
Volvox carteri f. nagariensis 69-1b 一种团藻 120 Mb, 14437 orfs 47
Brachypodium distachyon 短柄草 272 Mb,25,532 orfs 48
Glycine max cultivar Williams 82栽培大豆 1.1 Gb, 46430 orfs 49
Zea mays ssp. Mays Zea mays ssp. Parviglumis Zea mays ssp. Mexicana Tripsacum dactyloides var. meridionale 无法下载附表 50
Zea mays mays cv. B73玉米 2.06 Gb, 106046 orfs 51
Cucumis sativus 9930黄瓜 243.5 Mb, 63312 orfs 52
Micromonas pusilla金藻 21.7 Mb, 10248 orfs 53
Sorghum bicolor高粱 697.6 Mb, 32886 orfs 54
Phaeodactylum tricornutum三角褐指藻 24.6 Mb, 9479 orfs 55
Carica papaya L. papaya番木瓜 271 Mb (75%), 28,629 orfs 56
Physcomitrella patens patens小立碗藓 454 Mb, 35805 orfs 57
Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115 葡萄 504.6 Mb, 29585 orfs 58
Vitis vinifera PN40024 葡萄 475 Mb 59
Ostreococcus lucimarinus 绿色鞭毛藻 13.2 Mb, 7640 orfs 60
Chlamydomonas reinhardtii 莱茵衣藻 100 Mb, 15256 orfs 61
Populus trichocarpa 黑三角叶杨 550 Mb, 45000 orfs 62
Ostreococcus tauri 绿藻 12.6 Mb, 7892 orfs 63
Oryza sativa ssp. japonica 粳稻 360.8 Mb, 37544 orfs 64
Thalassiosira pseudonana硅藻 25 Mb, 11242 orfs 65
Cyanidioschyzon merolae 10D红藻 16.5 Mb, 5331 orfs 66
Oryza sativa ssp. japonica粳稻 420 Mb, 50000 orfs 67
Oryza sativa L. ssp. Indica籼稻 420 Mb, 59855 orfs 68
Guillardia theta 蓝隐藻 551 Kb, 553 orfs 69
Arabidopsis thaliana Columbia 拟南芥 119.7 Mb, 31392 orfs 70
動物
- Anopheles gambiae - 冈比亚按蚊
- Apis mellifera - 意蜂
- Bos taurus cattle - 牛
- Caenorhabditis briggsae - 一種線蟲
- Caenorhabditis elegans - 秀麗隱桿線蟲,模式生物
- Canis lupus familiaris dog- 狗
- Ciona intestinalis - 玻璃海鞘
- Ciona savignyi - 海鞘
- Drosophila melanogaster - 黑腹果蠅,模式生物
- Fugu rubripes - 河豚
- Gallus gallus - 雞
- Homo sapiens - 人
- Mus musculus - 小鼠,模式生物
- Pan troglodytes - 黑猩猩
- Rattus norvegicus - 大鼠
- Schistosoma haematobium - 埃及血吸虫
- Culex quinquefasciatus - 库蚊
- Solenopsis invicta - 火蚁
- Nasonia vitripennis - 金小蜂
- Linepithema humile - 阿根廷蚁
参考文献
1 Zhang, H. et al. Genome sequencing of the important oilseed crop Sesamum indicum L. Genome Biology 14, 401 (2013).
2 Chen, J. et al. Whole-genome sequencing of Oryza brachyantha reveals mechanisms underlying Oryza genome evolution. Nat Commun 4, 1595 (2013).
3 Collén, J. et al. Genome structure and metabolic features in the red seaweed Chondrus crispus shed light on evolution of the Archaeplastida. Proceedings of the National Academy of Sciences 110, 5247-5252 (2013).
4 Nakamura, Y. et al. The first symbiont-free genome sequence of marine red alga, susabi-nori Pyropia yezoensis. PLoS ONE 8, e57122 (2013).
5 Verde, I. et al. The high-quality draft genome of peach (Prunus persica) identifies unique patterns of genetic diversity, domestication and genome evolution. Nature Genetics advance online publication (2013).
6 Jia, J. et al. Aegilops tauschii draft genome sequence reveals a gene repertoire for wheat adaptation. Nature 496, 91-95 (2013).
7 Ling, H.-Q. et al. Draft genome of the wheat A-genome progenitor Triticum urartu. Nature 496, 87-90 (2013).
8 Peng, Z. et al. The draft genome of the fast-growing non-timber forest species moso bamboo (Phyllostachys heterocycla). Nature Genetics 45, 456-461 (2013).
9 Jain, M. et al. A draft genome sequence of the pulse crop chickpea (Cicer arietinum L.). Plant Journal, DOI: 10.1111/tpj.12173 (2013).
10 Varshney, R. K. et al. Draft genome sequence of chickpea (Cicer arietinum) provides a resource for trait improvement. Nat Biotech 31, 240-246 (2013).
11 Zhang, Q. et al. The genome of Prunus mume. Nat Commun 3, 1318 (2012).
12 Lee, M.-K. et al. Construction of a plant-transformation-competent BIBAC library and genome sequence analysis of polyploid Upland cotton (Gossypium hirsutum L.). BMC Genomics 14, 208 (2013).
13 Paterson, A. H. et al. Repeated polyploidization of Gossypium genomes and the evolution of spinnable cotton fibres. Nature 492, 423-427 (2012).
14 Xu, Q. et al. The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis). Nat Genet 45, 59–66 (2013).
15 Belknap, W. R. et al. Characterizing the citrus cultivar Carrizo genome through 454 shotgun sequencing. Genome 54, 1005-1015 (2011).
16 Guo, S. et al. The draft genome of watermelon (Citrullus lanatus) and resequencing of 20 diverse accessions. Nat Genet 45, 51–58 (2013).
17 Wang, N. et al. Genome sequence of dwarf birch (Betula nana) and cross-species RAD markers. Mol Ecol Article first published online: 21 NOV 2012 DOI: 10.1111/mec.12131 (2012).
18 Vieler, A. et al. Genome, functional gene annotation, and nuclear transformation of the heterokont oleaginous alga Nannochloropsis oceanica CCMP1779. PLoS Genet 8, e1003064 (2012).
19 Brenchley, R. et al. Analysis of the bread wheat genome using whole-genome shotgun sequencing. Nature 491, 705-710 (2012).
20 Consortium, T. I. B. G. S. A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome. Nature 491, 711–716 (2012).
21 Wang, K. et al. The draft genome of a diploid cotton Gossypium raimondii. Nature Genetics 44, 1098–1103 (2012).
22 Wang, Z. et al. The genome of flax (Linum usitatissimum) assembled de novo from short shotgun sequence reads. The Plant Journal 72, 461-473 (2012).
23 D'Hont, A. et al. The banana (Musa acuminata) genome and the evolution of monocotyledonous plants. Nature 488, 213–217 (2012).
24 Garcia-Mas, J. et al. The genome of melon (Cucumis melo L.). PNAS 109, 11872-11877 (2012).
25 reporter, A. G. s. Consortium releases pear genome data. GenomeWeb Daily News (2012).
26 Wu, J. et al. The genome of pear (Pyrus bretschneideri Rehd.). Genome Res.Published in Advance November 13, 2012, doi:10.1101/gr.144311.112 (2012).
27 Consortium, T. T. G. The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution. Nature 485, 635–641 (2012).
28 Bennetzen, J. L. et al. Reference genome sequence of the model plant Setaria. Nat Biotech 30, 555-561 (2012).
29 Zhang, G. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotech 30, 549-554 (2012).
30 Varshney, R. K. et al. Draft genome sequence of pigeonpea (Cajanus cajan), an orphan legume crop of resource-poor farmers. Nat Biotech 30, 83-89 (2012).
31 Radakovits, R. et al. Draft genome sequence and genetic transformation of the oleaginous alga Nannochloropis gaditana. Nat Commun 3, 686 (2012).
32 Young, N. D. et al. The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses. Nature 480, 520–524 (2011).
33 Wang, X. et al. The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa. Nat. Genet. 43, 1035-1039 (2011).
34 Consortium, T. P. G. S. Genome sequence and analysis of the tuber crop potato. Nature 475, 189-195 (2011).
35 Dassanayake, M. et al. The genome of the extremophile crucifer Thellungiella parvula. Nat. Genet. 43, 913-918 (2011).
36 Hu, T. T. et al. The Arabidopsis lyrata genome sequence and the basis of rapid genome size change. Nat. Genet. 43, 476-481 (2011).
37 Shulaev, V. et al. The genome of woodland strawberry (Fragaria vesca). Nat. Genet. 43, 109-116 (2011).
38 Argout, X. et al. The genome of Theobroma cacao. Nat. Genet. 43, 101-108 (2011).
39 Gobler, C. J. et al. Niche of harmful alga Aureococcus anophagefferens revealed through ecogenomics. PNAS 108, 4352-4357 (2011).
40 Banks, J. A. et al. The selaginella genome identifies genetic changes associated with the evolution of vascular plants. Science 332, 960-963 (2011).
41 Sato, S. et al. Sequence analysis of the genome of an oil-bearing tree, Jatropha curcas L. DNA Res. 18, 65-76 (2011).
42 Sakai, H. et al. Distinct evolutionary patterns of Oryza glaberrima deciphered by genome sequencing and comparative analysis. Plant Journal 66, 796-805 (2011).
43 Al-Dous, E. K. et al. De novo genome sequencing and comparative genomics of date palm (Phoenix dactylifera). Nat Biotech 29, 521-527 (2011).
44 Blanc, G. et al. The Chlorella variabilis NC64A genome reveals adaptation to photosymbiosis, coevolution with viruses, and cryptic sex. Plant Cell 22, 2943-2955 (2010).
45 Chan, A. P. et al. Draft genome sequence of the oilseed species Ricinus communis. Nat Biotech 28(951-956 (2010).
46 Velasco, R. et al. The genome of the domesticated apple (Malus x domestica Borkh.). Nat. Genet. 42, 833-839 (2010).
47 Prochnik, S. E. et al. Genomic analysis of organismal complexity in the multicellular green alga Volvox carteri. Science 329, 223-226 (2010).
48 Initiative, T. I. B. Genome sequencing and analysis of the model grass Brachypodium distachyon. Nature 463, 763-768 (2010).
49 Schmutz, J. et al. Genome sequence of the palaeopolyploid soybean. Nature 463, 178-183 (2010).
50 Hufford, M. B. et al. Comparative population genomics of maize domestication and improvement. Nat Genet 44, 808-811 (2012).
51 Wei, F. et al. The physical and genetic framework of the maize B73 genome. PLoS Genet 5, e1000715 (2009).
52 Huang, S. et al. The genome of the cucumber, Cucumis sativus L. Nat. Genet. 41, 1275-1281 (2009).
53 Worden, A. Z. et al. Green evolution and dynamic adaptations revealed by genomes of the marine picoeukaryotes Micromonas. Science 324, 268-272 (2009).
54 Paterson, A. H. et al. The Sorghum bicolor genome and the diversification of grasses. Nature 457, 551-556 (2009).
55 Bowler, C. et al. The Phaeodactylum genome reveals the evolutionary history of diatom genomes. Nature 456, 239-244 (2008).
56 Ming, R. et al. The draft genome of the transgenic tropical fruit tree papaya (Carica papaya Linnaeus). Nature 452, 991-996 (2008).
57 Rensing, S. A. et al. The Physcomitrella genome reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants. Science 319, 64-69 (2008).
58 Velasco, R. et al. A high quality draft consensus sequence of the genome of a heterozygous grapevine variety. PLoS One 2, e1326 (2007).
59 Jaillon, O. et al. The grapevine genome sequence suggests ancestral hexaploidization in major angiosperm phyla. Nature 449, 463-467 (2007).
60 Palenik, B. et al. The tiny eukaryote Ostreococcus provides genomic insights into the paradox of plankton speciation. PNAS 104, 7705-7710 (2007).
61 Merchant, S. S. et al. The Chlamydomonas genome reveals the evolution of key animal and plant functions. Science 318, 245-250 (2007).
62 Tuskan, G. A. et al. The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray). Science 313, 1596-1604 (2006).
63 Derelle, E. et al. Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features. PNAS 103, 11647-11652 (2006).
64 Project, I. R. G. S. The map-based sequence of the rice genome. Nature 436, 793-800 (2005).
65 Armbrust, E. V. et al. The genome of the diatom Thalassiosira Pseudonana: ecology, evolution, and metabolism. Science 306, 79-86 (2004).
66 Matsuzaki, M. et al. Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D. Nature 428, 653-657 (2004).
67 Goff, S. A. et al. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica). Science 296, 92-100 (2002).
68 Yu, J. et al. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. indica). Science 296, 79-92 (2002).
69 Douglas, S. et al. The highly reduced genome of an enslaved algal nucleus. Nature 410, 1091-1096 (2001).
70 Kaul, S. et al. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. Nature 408, 796-815 (2000).
外部連結
参见
- 基因组
- 全基因组测序
- 人类基因组计划
- 遗传学
- 已测序真核生物基因组列表
- 已测序古菌基因组列表
- 已测序细菌基因组列表
- 已测序质体基因组列表