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組織蛋白酶（英語：Cathepsin，縮寫CTS）是存在於所有動物以及其他生物體中的蛋白酶（降解蛋白質的酶）。這個家族大約有十幾個成員，它們的特點是它們的結構、催化機制以及切割的蛋白質。大多數成員可以在溶酶體中發現並在低pH值下被激活。因此，這個家族的活動幾乎完全在細胞器中。然而也有例外，例如組織蛋白酶K，它在破骨細胞分泌後在骨吸收過程中在細胞外起作用。組織蛋白酶在哺乳動物細胞更新中起著至關重要的作用。
這種蛋白質的缺乏與多種形式的神經氨酸酶中毒有關。惡性黑色素瘤轉移病灶裂解物中的組織蛋白酶A活性顯著高於主要焦點裂解物中的組織蛋白酶A活性。組織蛋白酶A在被肌肉萎縮症和去神經疾病影響的肌肉中增加。
組織蛋白酶B可作為β分泌酶1發揮作用，切割前類澱粉蛋白質以產生β澱粉樣蛋白。[10]作為肽酶C1家族成員的編碼蛋白的過表達，它與食管癌和其他腫瘤有關。[11]組織蛋白酶B還與包括卵巢癌在內的各種人類腫瘤的進展有關。
組織蛋白酶D（一種天冬氨醯蛋白酶）似乎可以切割多種底物，如纖連蛋白和層粘連蛋白。與其他一些組織蛋白酶不同，組織蛋白酶D在中性pH值下具有一些蛋白酶活性。[12]腫瘤細胞中這種酶的高水平似乎與更大的侵襲性有關。
組織蛋白酶K是最有效的哺乳動物膠原酶。組織蛋白酶K與骨質疏鬆症有關，骨質疏鬆症是一種骨密度降低導致骨折風險增加的疾病。破骨細胞是身體的骨吸收細胞，他們分泌組織蛋白酶K來分解膠原蛋白，它是骨頭的非礦物質蛋白基質的主要成分。[13]除其他組織蛋白酶外，組織蛋白酶K通過細胞外基質的降解在癌症轉移中發揮作用。[14]在患有動脈粥樣硬化的老鼠中，組織蛋白酶S和K的基因敲除被證明可以減少動脈粥樣硬化病變的大小。[15]組織蛋白酶K在培養的內皮細胞中的展現受剪切應力的調節。[16]組織蛋白酶K也被證明在關節炎中起作用。[17]
老鼠的組織蛋白酶L與人類的組織蛋白酶V同源。[18]老鼠的組織蛋白酶L已被證明在老鼠的脂肪生成和葡萄糖耐受不良中發揮作用。組織蛋白酶L降解纖連蛋白、胰島素受體（IR）和胰島素樣生長因子1受體（IGF-1R）。組織蛋白酶L缺陷的老鼠的脂肪組織較少，越低的血清葡萄糖和胰島素水平，越高的胰島素受體亞單位，葡萄糖轉運蛋白（GLUT4）和比野生型更多的纖連蛋白。[19]
五種環肽對人的組織蛋白酶L、B、H和K具有抑制活性。[20]幾種抑制劑已經進入臨床試驗，以組織蛋白酶K和S為目標，有望成為治療骨質疏鬆症、骨關節炎和慢性疼痛的藥物。由於不良副作用，組織蛋白酶K抑制劑Relacatib、Balicatib和Odanacatib分別在I、II和III期的臨床試驗期間終止。[21]SAR114137是一種組織蛋白酶S抑制劑，在慢性疼痛的I期之後沒有進展。2022年，組織蛋白酶L抑制劑STI-1558獲得美國食品藥品監督管理局（FDA）批准，開始治療2019冠狀病毒病（COVID-19）的I期研究。[22]
酶譜法是一種凝膠電泳，它使用與底物聚合的聚丙烯醯胺凝膠來檢測酶活性。組織蛋白酶酶譜法基於通過與明膠底物聚合的聚丙烯醯胺凝膠的遷移來分離不同的組織蛋白酶。電泳在非還原條件下進行，使用亮肽素保護酶免於變性。[23]確定蛋白質濃度後，將等量的組織蛋白質加入到凝膠中。然後讓蛋白質遷移通過凝膠。電泳後，將凝膠放入復性緩衝液中，以使組織蛋白酶恢復其天然構象。然後將凝膠放入特定pH值的活化緩衝液中，並在37°C下孵育並放置一夜。該活化步驟允許組織蛋白酶降解明膠底物。當凝膠使用考馬斯亮藍染色劑染色時，仍含有明膠的凝膠區域呈現藍色。組織蛋白酶活躍的凝膠區域顯示為白色條帶。該組織蛋白酶酶譜法已用於檢測飛摩爾量的成熟組織蛋白酶K。可以根據它們的遷移距離基於它們的分子量來識別不同的組織蛋白酶：組織蛋白酶K（~37kDa）、V（~35kDa）、S（~25kDa）和 L（~20kDa）。組織蛋白酶具有特定的pH水平，在該水平下它們具有最佳蛋白水解活性。組織蛋白酶K能夠在pH值為7和8下降解明膠，但這些pH值不能讓組織蛋白酶L和V有很高的活性。相反，在pH值為4時，組織蛋白酶V具有活性，但組織蛋白酶K沒有。調整活化緩衝液的pH值可以進一步識別組織蛋白酶類型。[24]
組織蛋白酶名稱來源於古希臘語，由kata-（倒下）和hepsein（煮沸）合併稱為Cathepsin。
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