中文
Sign in
AI tools
聊天
热门问题
时间线
Loading AI tools
全部
文章
字典
引用
地图
FASTA
来自维基百科,自由的百科全书
Found in articles
FASTA格式
在生物信息学中,
FASTA
格式是一种用于记录核酸序列或肽序列的文本格式,其中的核酸或氨基酸均以单个字母编码呈现。该格式同时还允许在序列之前定义名称和编写注释。这一格式最初由
FASTA
(英语:
FASTA
)软件包定义,但现今已是生物信息学领域的一项标准。
FASTA
FASTQ格式
该格式最初由维尔康姆基金会桑格研究所开发,旨在将
FASTA
格式序列及其质量数据整合在一起。而目前,FASTQ格式已经成为了保存高通量测序结果的事实标准。 FASTQ文件中,一个序列通常由四行组成: 第一行以@开头,之后为序列的标识符以及描述信息(与
FASTA
格式的描述行类似) 第二行为序列信息
BLAST (生物資訊學)
我們在做搜尋時的速度以及搜尋結果的精確度。因為當我們所要搜尋的目標資料庫非常龐大的時候,速度就變成一項很需要考量的因素。在像BLAST和
FASTA
(英语:
FASTA
)這些快速算法被開發之前,我們是使用动态规划算法來作資料庫的序列搜尋,這真的非常的耗時。BLAST使用啟發式搜索來找出相關的序列,在速度
奥兰主岛
奥兰主岛(瑞典語:
Fasta
Åland)是芬兰奥兰群岛中面积最大及人口最多的岛屿。奥兰自治区的区府玛丽港位于此岛上。大约群岛总人口中的90%居住在奥兰主岛上。奥兰主岛的面积为685平方公里。 奥兰主岛是芬兰海域中的最大的岛屿。在芬兰大陆的塞马湖中还有面积更大的索伊薩洛岛和塞明宁萨洛(芬蘭語:Sä
T-Coffee
(Mocca)。 預設比對結果輸出的格式為 aln (Clustal), 但也可產生其他 PIR, MSF,
FASTA
... 等格式。 常用的輸入格式多有支援 (
FASTA
, PIR)。 T-Coffee 的一個特點是可以結合其他方法或是不同的資訊。 在最新的版本中,T-Coffee 在進行多重序列比對,可以加入結構資訊