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朱清時（1946年2月7日—），男，四川彭州人[1][2][3]，祖籍安徽鳳陽，中國物理化學家，中國科學院院士，第三世界科學院院士，中國科學技術大學第七任校長（1998年－2008年），南方科技大學首任校長（2009年-2014年）。
朱清時為明朝皇室後裔，明太祖朱元璋第十一子朱椿蜀王之第二十世子孫。朱清時家族自明亡後輾轉定居於彭縣白鹿場鄉，為當地望族。[2]
朱清時父母均為四川彭州人，父親朱穆雍先後畢業於彭州中學和華西協和大學，朱清時為其第三子。[1][4]
朱清時早年先後就讀於成都金花街小學和成都十三中（成都華西中學）。1968年畢業於中國科學技術大學近代物理系。[1]
朱清時院士自1970年代中期開始從事雷射分離同位素研究，用雷射光壓偏析法分離鋰同位素取得成功。1980年代以後，在雷射光譜學、分子高振動態的實驗和理論研究中，取得一系列一流的研究成果。1990年代中期，在中國科學技術大學創建中國科學院選鍵化學重點實驗室，開展了對單分子化學的研究，並取得了一些重要進展。近幾年來，他大力倡導「綠色化學研究」，創建中國科學技術大學「生物質潔淨能源實驗室」。朱清時院士曾於1994年獲海外華人物理學會亞洲成就獎和學術雜誌《光譜化學學報》（Spectrochimica Acta）設立的湯普孫紀念獎、安徽省2000年度重大科技成就獎等多項獎。朱清時還榮獲日本創價大學名譽博士學位。
2008年4月23日，《南方周末》刊發題為「『高校評估該停了』專訪中科大校長朱清時」的報道[5]，引起了廣泛關注[6]。
2008年9月25日上午，中共中央組織部副部長李建華同志在中國科學技術大學教授幹部大會上宣布，國務院任命侯建國為中國科學技術大學校長（副部長級）。由於年齡原因，朱清時不再擔任校長職務。
2009年3月，被深圳市南方科技大學校長遴選委員推薦為校長第一候選人。
2009年9月10日，朱清時接受聘書，成為南方科技大學首任校長，被社會各界寄予高等教育改革厚望。
2014年9月1日，退休，不再擔任南方科技大學校長。
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英國皇家化學學會會士（FRSC）。
朱清時以科學家的實驗精神探索中國高教改革的出口，在擔任中國科學技術大學校長期間，抵制全國性的圈地、擴招大潮，說出「我對（中）科大主要的貢獻，不是做了什麼，而是沒有做什麼」這般有力度的話，被輿論稱作「中國最牛大學校長」。擔任南方科技大學校長期間，向教育部提出自授文憑和學位的願景[7]，理想是建一所能回答「錢學森之問」[8]的大學。[9] 據了解，在朱清時離任後，其擔任過校長的兩所高校均己完全摒棄朱清時的教育理論和實踐。目前，中科大和南科大均進入高速擴張發展階段，社會名譽也顯著增加。
2000年之後，朱清時的思想中宗教尤其是佛教的成分日漸增加。其著作《東方科學文化的復興》[10] 認為「以『整體論』為指導的東方科學思想將成為第二次科學革命的靈魂」。他主張「複雜性科學觀」，認為中醫學是「科學性之謎的鑰匙」。2003年8月，他在與友人劉正成談話時提及西藏的達隆活佛可以「（幾個月中）……就連這些東西都不吃了。吃石頭磨成的粉，聞周圍野花的氣味，就能夠吸收營養。」他認為這種辟穀是「佛教的這種修煉其實是兩千多年來人類做的一種實驗：心理的活動產生了生理上的巨大變化。這種變化在過去的自然科學，包括醫學和心理學都無從解釋。」[11] 對此新語絲網站專辟了「朱清時迷信事件」專欄[12]；中國科大BBS上有不少學生聲討朱清時[13]。
2009年3月8日，發表《物理學步入禪境：緣起性空》的宣傳佛教演講，認為當代物理學弦理論就是佛教的緣起性空觀點，「科學家千辛萬苦爬到山頂時，佛學大師已經在此等候多時了！」[14]
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