小菇科（學名：Mycenaceae）是傘菌目下的一個科，最早於1926年由荷蘭真菌學家卡斯帕爾·凡·歐沃瑞姆設立。2008年出版的真菌辭典（Dictionary of the Fungi）第十版中，列出了本科下分十個屬，共705個物種，本科也是經由序列分析後，從口蘑科拆分出來的科之一。本科物種多行腐生生長，廣泛分佈於全球各種生態系中[2]。本科之下有一屬Protomycena在一枚伊斯帕尼奧拉島的多明尼加琥珀中被發現[3]，出現於中新世布爾迪加爾階的地層，是目前化石紀錄中已發現的四個傘菌的屬之一[4]。
Quick Facts 科學分類, 模式屬 ...
小菇科
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| 盔蓋小菇
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科學分類 
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| 界：
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真菌界 Fungi
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| 門：
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擔子菌門 Basidiomycota
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| 綱：
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傘菌綱 Agaricomycetes
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| 目：
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傘菌目 Agaricales
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| 科：
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小菇科 Mycenaceae
Overeem（1926）
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| 模式屬
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小菇屬 Mycena
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| 屬
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Close
2002年一篇大規模的種系發生學研究以核糖體大次單元的基因序列分析傘菌目下各類群的親緣關係，以小菇科之名描述一個包含網孔菌屬、膠孔菌屬、小菇屬、扇菇屬、孔小菇屬、脂小菇屬、Mycenoporella與Prunulus等屬、可信度較高的演化支[5]。後來網孔菌屬被併入扇菇屬中，孔小菇屬與Prunulus則皆被併入小菇屬中。
本科包括以下屬：
- Amparoina Singer, 1958
- Amparoina T.Bau & Q.Na
- 雅典娜小菇屬 Atheniella Redhead, Moncalvo, Vilgalys, Desjardin & B.A.Perry
- Cruentomycena R.H.Petersen, Kovalenko & O.V.Morozova
- 變色赤小菇 Cruentomycena allochroa T.Bau & L.N.Liu
- Cruentomycena kedrovaya R.H.Petersen, Kovalenko, O.V.Morozova & Mycotaxon
- Cruentomycena kedrovayae R.H.Petersen, Kovalenko & O.V.Morozova
- Cruentomycena orientalis Har.Takah. & Taneyama
- Cruentomycena uttarakhandina U.Singh & R.P.Bhatt
- Cruentomycena viscidocruenta (Cleland) R.H.Petersen & Kovalenko
- Decapitatus S.A.Redhead & K.A.Seifert, 2000
- Dictyopanus Pat.
- Dictyoploca
- 膠孔菌屬 Favolaschia (Pat.) Pat., 1892
- Filoboletus Henn.
- Flabellimycena S.A.Redhead, 1984
- Galactopus
- 膠傘屬 Heimiomyces Singer, 1942
- 半小菇屬 Hemimycena Singer
- Hydropus Kühner ex Singer
- Insiticia
- 小菇屬 Mycena (Pers.) Roussel, 1806
- Mycenoporella Overeem
- Mycomedusa
- Mycopan Redhead, Moncalvo & Vilgalys
- Omphalopsis Earle, 1909
- 扇菇屬 Panellus P.Karst.
- Phlebomarasmius
- Poromycena Overeem
- Prunulus Gray
- 脂小菇屬 Resinomycena Redhead & Singer
- 黏柄小菇屬 Roridomyces Rexer
- 幕蓋菇屬 Tectella Earle
- Urospora
- Urosporellina E.Horak, 1968
- 干臍菇屬 Xeromphalina Kühner & Maire
Moncalvo JM, Vilgalys R, Redhead SA, Johnson JE, James TY, Catherine Aime M, Hofstetter V, Verduin SJ, Larsson E, Baroni TJ, Greg Thorn R, Jacobsson S, Clémençon H, Miller OK Jr. One hundred and seventeen clades of euagarics. Molecular Phylogenetics and Evolution. 2002, 23 (3): 357–400 [2018-09-12]. PMID 12099793. doi:10.1016/S1055-7903(02)00027-1. （原始內容存檔於2018-03-24）.
