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吳雲東（1957年5月—），江蘇溧陽人，理論有機化學家，中國科學院院士，北京大學教授。曾任北京大學深圳研究生院院長[1]。
1957年5月出生在江蘇。1981年畢業於蘭州大學化學系。之後留學美國匹茲堡大學化學系，師從Kendall N. Houk教授，於1986年取得該系博士學位。主要從事理論計算化學研究，專注於化學反應機理，多肽等生物分子結構研究。
返國後，先是在香港科技大學化學系擔任講座教授，因千人計劃的原因而全職回歸北京大學，曾任北京大學理論與計算化學研究所所長，重慶大學文理學部主任，北京大學深圳研究生院院長[1]。
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