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反義寡核苷酸（antisense oligonucleotide）通常指進行了某些化學修飾的短鏈核酸（約15-25個核苷酸組成），它的鹼基順序排列與特定的靶標RNA序列互補，進入細胞後可按照Watson-Crick鹼基互補配對的原則與靶標序列形成雙鏈結構。反義寡核苷酸與靶標基因的RNA結合後可通過各種不同的機制影響靶標基因的表達。
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反義寡核苷酸可用於基因沉默，所以是一種研究基因功能的重要工具。大多數藥物屬於靶標基因（或疾病基因）的抑制劑，因此反義寡核苷酸模擬了藥物的作用，這功能丟失（LOF）的研究方法比傳統的功能獲得（GOF）方法更具優勢。同時，那些在靶標實驗中證明有效的反義寡核苷酸本身還可以被進一步開發成為反義寡核苷酸藥物。
- 新藥藥物靶標開發技術，2006年版，高等教育出版社，ISBN 7-04018953-4
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