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內肽酶(endopeptidase)又稱內切蛋白酶(endoproteinase),是蛋白水解肽酶,可催化多肽鏈中非末端(即分子內)肽鍵的水解,正好與外肽酶相反(可催化末端肽鍵的水解)[1]。因此,內肽酶不能將肽分解成單體,而外肽酶可以將蛋白質分解成單體。內肽酶的一個特例是寡肽酶,其底物是寡肽而不是蛋白質。
它們通常對某些胺基酸非常特異。內肽酶的例子包括:
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