严重急性呼吸综合征冠状病毒2-Alpha变异株(英语:SARS-CoV-2 Alpha variant),别名B.1.1.7谱系(英语:Lineage B.1.1.7),是严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的一种变异株,世界卫生组织将其列为“高关注变异株”(VOC),原因是其传播性较严重的严重急性呼吸综合征冠状病毒2高70%[2](香港大学团队估算传播力高75%[3])。2020年11月2019冠状病毒疾病英国疫情期间,此变种病毒在9月首次从英国采集的样本中发现,并在12月中旬开始在该国快速传播[4]。
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Alpha | |
一般细节 | |
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世卫组织指称 | Alpha |
谱系 | B1.1.1.7 |
首次检测到 | 英格兰肯特郡 |
报告日期 | 2020年11月 |
地位 | 需要关注的变异株 |
症状 | |
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病例地图 | |
主要变异株 | |
根据英格兰公共卫生署2021年8月报告,2月至8月Alpha变异株病例死亡率1.1%,新版Delta变异株则0.3%(如只计无注射疫苗则0.21%)[5]。
名称
此变种病毒有多个名称,在英国境外有时称之为英国变种病毒[6](英语:U.K. variant 或 British variant)。在英国,因为此变种病毒首先在肯特郡被发现,所以在之后将其称为肯特郡变种病毒(英语:Kent variant)[7]。
在科学用途中,此变种病毒起初被命名为VUI-202012/01(英语:First Variant Under Investigation in December 2020,意为“2020年12月首个被调查的变种”)[8],但在2020年12月21日发布的报告中,英格兰公共卫生部将其重新归类为值得关注的变种病毒[9]。在代表新冠病毒基因组学英国联盟(COG-UK)撰写的报告中,他们根据PANGOLIN的系统将其命名为B.1.1.7谱系。[10]
2021年5月31日,世界卫生组织为几种主要的变异病毒株以希腊字母命名,以避免地名命名导致污名化的问题,其中B.1.1.7命名为Alpha,世卫表示此命名并不会取代科学名称。[11]此后中国大陆媒体往往据此将其音译为阿尔法毒株。台湾则直接称作Alpha变异株。
遗传图谱
SARS-CoV-2的突变是常见的:根据英国COVID-19基因组学联盟的数据,仅在其棘蛋白中就检测到4000多个突变[13]。
探测
属于B.1.1.7谱系的两个最早的基因组分别于2020年9月20日在肯特郡和9月21日在大伦敦采集[10]。这些序列被提交到全球共享流感数据倡议组织(GISAID)序列数据库(序列登录名分别为EPI_ISL_601443和EPI_ISL_581117)。截至12月15日,B.1.1.7谱系共有1623个基因组。其中519个样本在大伦敦,555个在肯特郡,545个在英国其他地区(包括苏格兰和威尔士),4个在其他国家/地区[10]。
使用遗传证据进行的反向追踪表明,这一新变种于2020年9月出现,然后以极低的水平在人群中传播,直到11月中旬。11月下旬,当英国公共卫生局(PHE)正在调查为何肯特郡的感染率尽管受到国家限制而没有下降时,发现了与该新变种有关的病例。随后,PHE发现一个与这种变异体有关的簇(cluster)正在迅速蔓延到伦敦和埃塞克斯郡[14]。
症状
根据伦敦帝国理工学院对英格兰100多万人进行的社区传播实时评估(REACT)研究,发现Alpha变异株的一系列与COVID-19相关的额外症状,其中发冷、食欲不振、头痛和肌肉酸痛是最典型的症状。[15][需要可靠医学来源]
参见
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2变异株
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2Beta变异株
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2Gamma变异株
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2变异株B.1.617谱系(Delta变异株及Kappa变异株)
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2Lambda变异株
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2Mu变异株
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2奥密克戎变异株
- 严重急性呼吸综合征冠状病毒2IHU变异株
参考文献
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