耶稣所爱的门徒（希腊语：ο μαθητης ον ηγαπα ο Ιησους, o mathētēs on ēgapa o Iēsous，英语：disciple whom Jesus loved），或是门徒、爱徒（希腊语：ον εφιλει ο Ιησους, on ephilei o Iēsous，英语：Beloved Disciple），出现于《约翰福音》之中，但是在约翰福音中，并没有明确写出这位门徒的身份。这是约翰福音独有的内容，在《新约》其他的部分，不曾记载耶稣曾经使用过这样的话。
《约翰福音》中没有明说他的身份，基督教会传统上相信，他是使徒之一的约翰。
耶稣所爱的门徒，在《约翰福音》中提到六次：
- 他曾参与耶稣最后的晚餐，在西门彼得的示意下，曾询问耶稣，是谁将出卖他[1]。
- 在耶稣死前，他将他的母亲，马利亚，交托给这位门徒。在记载中，耶稣称马利亚，是这位所爱门徒的母亲[2]。
- 在耶稣死后，信徒发现他的尸体失踪，这位门徒是第一个进入墓穴的[3]。
- 这位门徒也是最早见到耶稣死后显现的信徒之一，他见证耶稣第三次显现，让他们捕获153条鱼的奇迹[4]。
- 耶稣第三次显现，与众门徒一同吃早餐。在耶稣与彼得谈话时，这位门徒也在现场[5]。
- 福音书作者约翰，在《约翰福音》结尾，声明他写作的目的，是为了这位耶稣所爱的门徒作见证[6]。
在《约翰福音》中，提到一位曾经是施洗约翰的门徒，跟安得烈一同成为耶稣最早的门徒[7]。耶稣遭逮捕之后，彼得曾与一位门徒进大祭司的家中，探察耶稣的消息[8]。这两个段落，提到的另一位无名门徒，可能也是指这位耶稣所爱的门徒[6]。
从二世纪开始，基督教会相信，耶稣所爱的门徒，即是指十二使徒中，年纪最小的使徒，约翰，也就是福音书作者约翰。
根据《约翰福音》，这个门徒可能是指拉撒路[9][10][11]。
根据伪经《马利亚福音》与《腓力福音》，在其门徒中，耶稣给与抹大拉的马利亚特别的地位。
这个说法的支持者指出，《约翰福音》的两个章节[2][3]，是在公元2世纪才出现的，目的可能是为了把抹大拉的马利亚，与耶稣所爱的门徒分开。
参考《约翰福音》21:4-7,这位门徒和赤身的彼得一起捕鱼， 所以应该是男的。
学者詹姆斯·泰伯（James D. Tabor）认为，耶稣所爱的门徒，可能是指若瑟元配的儿子，耶稣的兄弟，公义者雅各[12][13]。
《约翰福音》13:24-25：“有一个门徒、是耶稣所爱的、侧身挨近耶稣的怀里。西门彼得点头对他说、你告诉我们、主是指著谁说的。那门徒便就势靠着耶稣的胸膛、问他说、主阿、是谁呢。 ” 《约翰福音》19:25-27：“站在耶稣十字架旁边的，有他母亲与他母亲的姊妹，并革罗罢的妻子马利亚，和抹大拉的马利亚。耶稣见母亲和他所爱的那门徒站在旁边，就对他母亲说：母亲（原文作妇人），看，你的儿子！又对那门徒说：看，你的母亲！从此，那门徒就接他到自己家里去了。”
《约翰福音》20:1-4：“七日的第一日清早，天还黑的时候，抹大拉的马利亚来到坟墓那里，看见石头从坟墓挪开了，就跑来见西门彼得和耶稣所爱的那个门徒，对他们说：有人把主从坟墓里挪了去，我们不知道放在哪里。彼得和那门徒就出来，往坟墓那里去。两个人同跑，那门徒比彼得跑的更快，先到了坟墓，低头往里看，就见细麻布还放在那里，只是没有进去。西门彼得随后也到了，进坟墓里去，就看见细麻布还放在那里，又看见耶稣的裹头巾没有和细麻布放在一处，是另在一处卷著。先到坟墓的那门徒也进去，看见就信了。”
《约翰福音》21:4-7：“天将亮的时候、耶稣站在岸上．门徒却不知道是耶稣。耶稣就对他们说、小子、你们有吃的没有。他们回答说、没有。耶稣说、你们把网撒在船的右边、就必得着。他们便撒下网去、竟拉不上来了、因为鱼甚多。耶稣所爱的那门徒对彼得说、是主。那时西门彼得赤著身子、一听见是主、就束上一件外衣、跳在海里。”
《约翰福音》21:19-23：“彼得转过来，看见耶稣所爱的那门徒跟着，（就是在晚饭的时候，靠着耶稣胸膛说：“主啊，卖你的是谁？”的那门徒。）彼得看见他，就问耶稣说：主啊，这人将来如何？耶稣对他说：我若要他等到我来的时候，与你何干？你跟从我吧！于是这话传在弟兄中间，说那门徒不死。其实，耶稣不是说他不死，乃是说：我若要他等到我来的时候，与你何干？” 《约翰福音》21:24：“为这些事作见证、并且记载这些事的、就是这门徒。我们也知道他的见证是真的。” 《约翰福音》1:35-40：“再次日、约翰同两个门徒站在那里。他见耶稣行走，就说：看哪，这是 神的羔羊。两个门徒听见他的话、就跟从了耶稣。耶稣转过身来、看见他们跟着、就问他们说、你们要什么。他们说、拉比、在那里住。（拉比翻出来、就是夫子。)耶稣说、你们来看。他们就去看他在那里住、这一天便与他同住、那时约有申正了。听见约翰的话、跟从耶稣的那两个人、一个是西门彼得的兄弟安得烈。 ” 《约翰福音》18:15-16：“西门彼得跟着耶稣，还有一个门徒跟着。那门徒是大祭司所认识的，他就同耶稣进了大祭司的院子。彼得却站在门外。大祭司所认识的那个门徒出来，和看门的使女说了一声，就领彼得进去。 ”
《约翰福音》11:1-3：“有一个患病的人，名叫拉撒路，住在伯大尼，就是马利亚和他姐姐马大的村庄。这马利亚就是那用香膏抹主，又用头发擦他脚的；患病的拉撒路是他的兄弟。他姊妹两个就打发人去见耶稣，说：主啊，你所爱的人病了。”
《约翰福音》11:5：“耶稣素来爱马大、和他妹子、并拉撒路。”
《约翰福音》11:32-36：“马利亚到了耶稣那里，看见他，就俯伏在他脚前，说：主啊，你若早在这里，我兄弟必不死。耶稣看见他哭，并看见与他同来的犹太人也哭，就心里悲叹，又甚忧愁，便说：你们把他安放在哪里？他们回答说：请主来看。耶稣哭了。犹太人就说：你看他爱这人是何等恳切。”
《马可福音》6:3：“这不是那木匠么？不是马利亚的儿子－雅各、约西、犹大、西门的长兄（原文为兄弟）么？他妹妹们不也是在我们这里么？他们就厌弃他。”
《马太福音》13:55：“这不是木匠的儿子么？他母亲不是叫马利亚么？他弟兄们不是叫雅各、约西〔有古卷作约瑟〕、西门、犹大么？”
