鼠海豚科（学名：Phocoenidae）是齿鲸的一个演化支，与独角鲸科为姊妹群，现存约 3 属 7 种，外形类似海豚但体型较小且吻部不突出。
下级分类
鼠海豚科 Phocoenidae
- †原鼠海豚属 Archaeophocaena
- †南方鼠海豚属 Australithax
- †Brabocetus
- †羽幌鼠海豚属 Haborophocoena
- †洛马鼠海豚属 Lomacetus
- †中新鼠海豚属 Miophocaena
- †沼津鼠海豚属 Numataphocoena
- †皮斯科鼠海豚属 Piscolithax
- †翼鼠海豚属 Pterophocaena
- †沙利曼鼠海豚属 Salumiphocaena
- †半喙鼠海豚属 Semirostrum
- †玫巧豚属 Septemtriocetus
- 露脊鼠海豚属 Neophocaena
- 白腰鼠海豚属 Phocoenoides
- 白腰鼠海豚 P. dalli
- 鼠海豚属 Phocoena
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