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马氏鳄亚科(学名:Mekosuchinae),又称为梅科鳄亚科,是澳洲及南太平洋大洋洲的鳄鱼亚科,现已灭绝。化石纪录显示牠们最初于始新世的澳洲出现,并一直生存在澳洲至更新世人类到达时,以及在斐济、新喀里多尼亚及瓦努阿图至全新世。其分类被受争议:一些认为应为鳄科之下的一个亚科;也有指应为一个独立的科,并与鳄科同属鳄总科。
马氏鳄亚科是一个颇为多样性的群组。当中的Mekosuchus inexpectatus,估计为本亚科最后一个存活的物种,要到全新世时才于新喀里多尼亚灭绝[1]。科学家估计这个物种还是一个树栖的物种[1]。至于中新世早期的物种Harpacochampsa camfieldensis估计与今日马来长吻鳄的型态相像。另一种在新西兰的中新世沉积层发现的化石,至今仍未被描述。马氏鳄物种则幸运地可透过“跳岛”(island-hopping)的形式扩散其分布至南太平洋诸岛:估计牠们首成横渡珊瑚海至一个今日已被海水淹过的切斯特菲尔德群岛,然后迁往新喀多尼亚,再往其他岛屿迁徙[1]。
马氏鳄亚科几乎各属物种的数量在后中新世的澳大利亚都急剧下降,除了金卡纳鳄属和沼王鳄属的物种不受影响[2]。这两属的物种要到上新世末期的第四纪灭绝事件发生时才消失[2]。其他物种在瓦努阿图及新喀里多尼亚则待至人类到达才灭绝[2]。