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如同输尿管，肾盂的表面被一层仅有数个细胞厚的黏膜所覆盖，而黏膜分别是由上方的移行上皮以及下方的结缔组织组成的。黏膜呈现部分重叠的现象，这是为了让尿液经过时肾盂能够扩张。黏膜下方连接的是肌肉层，纵肌与环肌的搭配收缩帮助了尿液排至输尿管及膀胱中。对尿液而言，肾盂是不具有通透性的，这也代表着肾盂不参与尿液的再吸收作用。
正常人体的尿液形成过程是肾小球首先将血液里的代谢废物滤出，经过肾小管再吸收后输送至集尿管，再由数个集尿管汇合到肾盂，最后肾盂会如漏斗般将尿液收集至输尿管中。
肾盂是多种肾癌的发生位置。
肾盂的大小与肾积水的严重程度直接相关。正常而言，32周胚胎的肾盂前后径小于4毫米，随着胚胎的成长会增加至7毫米。[1]在成年人中，只有13%人口的肾盂横向直径超过1公分。[2]
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