孔元(13世纪—1282年),字彦亨,元朝真定府(今河北省正定县)人。
孔元骁勇有智略。1237年,弃家投奔丞相史天泽军中,多次跟随他从征战。跟随他攻取南宋焦湖,围寿春,征安丰,围泗州,多有战功。蒙哥时参加攻打五堂山寨、樊城。中统元年(1260年),跟随忽必烈北征阿里不哥,升管军总把。至元十一年(1274年),伐南宋,为前锋,所向克捷。至元十四年(1277年),进管军千户。至元十五年(1278年),为侍卫亲军千户。至元十六年(1279年),跟随行院别乞里迷失讨平昔里吉等,为宣武将军、右卫亲军总管。至元十九年(1282年)病亡。