利文索尔佯谬
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利文索尔佯谬(Levinthal's paradox)是指一个思想实验,也是蛋白质折叠理论中的一个自指。在1969年, 美国分子生物学家Cyrus Levinthal指出,由于在未折叠的多肽链中的非常大量的自由度,该分子具有天文数量的可能构象。在一篇论文中[1],他估计了3 300 或10 143(通常被错误地引用为1968年的论文[2])。例如,一个由100个氨基酸残基组成的多肽,将具有99个肽键,并且因此具有198个不同的phi和psi键角。如果这些键角中的每一个可以是三个稳定构象之一,则蛋白质可错误折叠成最多达到3198种不同构象(包括任何可能的折叠冗余)。因此,如果蛋白质通过连续采样所有可能的构象而获得其正确折叠的构型,则需要比宇宙的年龄更长的时间以达到其正确的天然构象。即使以快速(纳秒或皮秒)速率采样构象,这也是真的。 “悖论”是大多数小蛋白质在毫秒或甚至微秒时间尺度上同时折叠。这种悖论的解决方案已经通过蛋白质结构预测的计算方法建立[3]。
此佯谬表明蛋白质折叠遵循特异性途径,或者其过程中只尝试有限数目的构象。