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東京開成學校（日语：開成学校）與東京醫學校（日语：東京医学校）。歷1886年更名「帝國大學」，1897年易名「東京帝國大學」後，1947年復用現名。2004年依法改制國立大學法人。2017年成为首批「指定國立大學法人」。 東京大學沒有特別彰明其文化的創校精神。但在國立大學法人化之後，制定了《東京
國立研究開發法人國立癌研究中心（日语：国立がん研究センター／こくりつがんけんきゅうセンター、National Cancer Center）是日本的國立研究開發法人（日语：国立研究開発法人）。做為國立高度專門醫療研究中心（日语：国立高度専門医療研究センター）（國家中心）之一，是日本對抗癌症的核心機構
立川災害對策本部預備設施為中心，聚集自衛隊、東京消防廳、警視廳、醫療機關等設施，是可成為以內閣總理大臣擔任本部長的緊急災害對策本部（日语：災害対策本部）。國立醫院機構災害醫療中心（日语：国立病院機構災害医療センター）是災害派遣醫療隊（日语：災害派遣医療チーム）（DMAT）進行培訓的災害據點醫院，在東
大學共同利用機關法人 自然科學研究機構（日语：自然科学研究機構）國立天文台（大澤） 獨立行政法人 宇宙航空研究開發機構調布航空宇宙中心飛行場分室（日语：調布航空宇宙センター）（大澤） 海上技術安全研究所（日语：海上技術安全研究所）（新川） 特殊法人（日语：特殊法人） 日本政策金融公庫（日语：日本政策金融公庫）
國土交通省關東運輸局東京運輸支局八王子自動車檢查登錄事務所 自衛隊東京地方協力本部（日语：地方協力本部）八王子地域事務所 內閣府宮內廳多摩陵墓監區事務所 日本年金機構（日语：日本年金機構）八王子年金事務所 自動車檢査獨立行政法人（日语：自動車検査独立行政法人）關東檢査部八王子事務所 獨立行政法人都市再生機構東日本支社南八王子開發事務所