連江縣政府是中華民國福建省連江縣最高層級的地方行政機關，中華民國政府架構中為縣自治的行政機關，同時負責執行中央機關委辦事項，連江縣的自治監督機關為行政院內政部。連江縣政府也是轄下各鄉的地方自治監督機關。