慕尼黑东站在站前(西北侧)的奥尔良广场(德语:Orleansplatz),可以通过慕尼黑交通公司开办的巴士有轨电车换乘至市内交通。广场下方是地铁U4线(德语:Stammstrecke 3 (U-Bahn München))的车站。这三种交通方式连同城市快铁均已被纳入慕尼黑交通及资费集团的资费区间。其它的市内巴士线则在车站东南侧的和平街上停靠。
慕尼黑城市快铁和多条既有的市郊铁路。它们均为电气化铁路并通过一条隧道相连。这条所谓的“主线(德语:Stammstrecke (S-Bahn München))”最初被称为“连接线(Verbindungsbahn, 简称V-Bahn)”,走向是从火车总站穿越慕尼黑内城直至火车东站。如今,慕尼黑快铁日均发送旅客量达7
慕尼黑地鐵(U-Bahn München))由U3和U6线使用(慕尼黑自由广场至因普勒街路段),站牌的标志色为蓝色。U1和U2线在火车总站至哥伦布广场间使用第二条主线铁路(德语:Stammstrecke 2 (U-Bahn München)),配备红色的路线带(德语:Linienband)。最后建成的主线铁路,即3号主线(德语:Stammstrecke
慕尼黑火车总站在慕尼黑地铁第三主线(德语:Stammstrecke 3 (U-Bahn München))中的地铁站位于慕尼黑总站南侧及东西向的拜耳大街地下二层。该站在规划阶段曾被定名为“总站南站(Hauptbahnhof Süd)”,但在1984年3月10日投入营运后,它仅使用总站的称谓。其银
慕尼黑主要路线在内城的路段都被集成至一条中央主线隧道(德语:Stammstrecke (S-Bahn München))内。为了减轻对技术上仍然可行的繁忙隧道的负荷,当局正在筹备新建一条平行的第二主线铁路(德语:Zweite Stammstrecke)。第二主线铁路有望在2028年投入运营。而计划中的快