MHC class II molecules

交叉呈遞是十分重要的，因為他允許了外來抗原的呈現。這些抗原平常時是由樹突細胞利用MHC II（英语：MHC II）呈現給抗原呈現細胞，現在發現他們也可透過MHC I呈現。MHC I通常是用來呈現已經感染細胞的內在抗原。然而，利用交叉呈遞的細胞可以利用MHC I路徑來呈現，這樣便可防止細胞被感染，並刺激適應性免疫系統來

Porcelli SA, Brenner MB. Antigen presentation by CD1 and MHC-encoded class I-like molecules.. Curr. Opin. Immunol. 1996, 8 (1): 82–8. PMID 8729450. doi:10

Ii的蛋白水解很重要，因为它有助于CLIP从MHC II上解离，以便复合物得以加载选定的抗原。加载抗原后，MHC II分子移动到细胞表面。因此，我们可以推测组织蛋白酶S的过度表达可能会导致Ii的过早降解、MHC II的临时加载和自身的免疫攻击。相反，组织蛋白酶S的抑制将导致Ii的降解、将抗原加载到MHC

細胞會製造針對特定甲狀腺抗原的抗體。在橋本氏甲狀腺炎，活化的 CD4+ T細胞會分泌干擾素-γ，使甲狀腺細胞在細胞表面顯示主要組織相容性複合體第II型分子（英语：MHC class II molecules），這會刺激具自體反應性的T細胞族群數量增加，並延長後續的發炎反應。 雖然會用檢測抗甲狀腺抗體來追蹤與診斷自體免疫甲狀

Liu KY, Huang XJ. T cell exhaustion characterized by compromised MHC class I and II restricted cytotoxic activity associates with acute B lymphoblastic