Foldit

Foldit是一個實驗性的蛋白質摺疊電子遊戲，結合了眾包與分散式計算的思想。由華盛頓大學的電腦科學和工程學系和生物化學學系（同一批人中，很多人也參與建立Rosetta@home）聯合共同開發。

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Foldit提供一系列教程，讓用戶試着操縱簡單的類蛋白質構造，並定期更新以真實蛋白質結構為基礎的謎題。該程式讓用戶在工具輔助解謎，就能夠得出實際的蛋白質模型。每當結構被變動，一個「分數」會根據摺疊的完善程度給出。Foldit用戶可以創立加入小組，分享各自的方案。也有小組高分榜。

生物製造主要蛋白質結構的方式（蛋白質生物合成）在原理上已經為人類所理解，此即蛋白質DNA測序的方法。而解明肽鏈是如何摺疊成三維的蛋白質結構更為困難；雖然大致的程式已經為人所知，但蛋白質結構預測還是需要大量的運算。

Foldit嘗試利用人腦天生的三維圖形匹配能力。目前該程式出的謎題都是基於已被人們清楚瞭解的蛋白質；透過分析人類在解這些謎題時的直覺思考途徑，研究者希望能改進現有蛋白質摺疊軟件所用的演算法。

2010年科學雜誌《自然》雜誌上的一篇論文稱，Foldit的57,000名參與者提供了有用的結果，這些結果與演算法計算的解決方案相匹配或表現優異^[1]^[2]。

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成就

2011年，Foldit玩家幫助解讀了Mason-Pfizer猴病毒（M-PMV）逆轉錄病毒蛋白酶的晶體結構。科學家們一直研究愛滋病的逆轉錄酶的晶體結構，這是一個已有十五年之久未解決的科學問題，這種蛋白質酶是愛滋病毒在活體細胞中複製和繁殖自己的重要關鍵，但在遊戲中逆轉錄酶的結構在十天內被玩家們破解^[3]^[4]。

[1]
John Markoff. In a Video Game, Tackling the Complexities of Protein Folding. The New York Times. 10 August 2010 [12 February 2013]. （原始內容存檔於2018-08-13）.
[2]
存档副本. [2018-08-13]. （原始內容存檔於2018-10-27）.
[3]
Khatib, F.; Dimaio, F.; Cooper, S.; Kazmierczyk, M.; Gilski, M.; Krzywda, S.; Zabranska, H.; Pichova, I.; Thompson, J. Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players. Nature Structural & Molecular Biology. 2011, 18 (10): 1175. doi:10.1038/nsmb.2119.
[4]
Praetorius, Dean. Gamers Decode AIDS Protein That Stumped Researchers For 15 Years In Just 3 Weeks. The Huffington Post. 2011-09-19 [17 November 2016]. （原始內容存檔於2017-06-21）.

Return to the fold. The Economist. 2008-05-08 [2008-05-25]. （原始內容存檔於2019-10-16）.

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