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2019冠狀病毒病日本疫情時間軸（日語：日本における2019年コロナウイルス感染症の流行のタイムライン／にっぽんにおける2019ねんコロナウイルスかんせんしょうのりゅうこうのタイムライン），以時間軸形式介紹2019冠狀病毒病（COVID-19）在日本的疫情。
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此條目介紹的是流行病學角度為主的新型冠狀病毒感染症 (COVID-19) 日本疫情時間軸。
- 關於鑽石公主號的群聚感染，請見「2019冠狀病毒病國際郵輪疫情」。
- 關於日本政府及自治體的疫情應對時間軸，請見「2019冠狀病毒病日本行政應對」。
- 關於疫情對日本經濟及社會造成的影響，請見「2019冠狀病毒病日本社會經濟影響」。
2019冠狀病毒病日本疫情可按國內不同病毒的基因組序列分為2波[1][2]。國立感染症研究所的基因研究顯示，第1波疫情的變異株來源於中國及東亞患者中流行的武漢型，2020年1月透過中國旅客及回國者侵入日本[3]，3月在日本全國引發多個感染群組（聚集性疫情）後慢慢消失。1月16日，日本透過醫學檢查，確認國內出現首宗個案，為從武漢回國的神奈川縣居民。
繼第1波後，日本又發生歐洲型病毒引發的第2波疫情，變種可追溯至法國、意大利、瑞典、英國的早期患者。3月26日，日本透過醫學檢查發現第2波疫情，當時政府專家會議得出結論，認為3月11日至3月23日期間，歐美旅客及回國者很可能已引發新的疫情[4]。國立感染症研究所發佈研究數據，證明日本3月起流行的病毒中大部分是歐洲型，又指結論「強烈顯示」，尋找感染源頭及密切接觸者的主動流行病學調查取得成效，成功控制住武漢型病毒，但3月的行動限制不足，導致3月下旬至4月中旬，歐洲型病毒傳入國內並擴散[5]。
3月中旬起急速擴大的疫情，在4月上旬達至高峰後逐漸減速，5月中旬一度轉為平緩[6]。5月25日，面向全國發出的緊急事態宣言全部解除；6月19日，面向全國發出的避免跨縣境移動請求全面解除[6]。不過，6月中旬起，以大都市圈為中心，新增確診個案再次轉趨增加[6]。去到7月中，每日新增確診個案已迫近4月時的高峰水平[7]，單日個案有時會超過600宗[8]，7月22日更錄得795宗確診個案[9]。
- 1月28日，出現國內第6宗[19]（國內首宗日本人及奈良縣首宗個案[20]）、國內第7宗[21]（北海道首宗[22]）確診個案，當中有未去過武漢，但1月前半接載過武漢旅行團的旅行巴士男性司機[19]。29日，旅行團的女性巴士向導亦出現陽性反應（國內第8宗[23]、大阪府首宗[24]）。
- 1月30日，搭乘前一日的政府包機（第1班）從武漢回國的3名日本人確診，當中有2名無徵狀病原體保有者[30]。
- 1月31日早間7時45分左右，第3班包機從武漢機場起飛，10時20分左右抵達羽田機場[34]。同日，千葉縣出現首宗確診個案，為接待中國旅行團的女性巴士向導[35]。
- 2月1日早間0時起，依照出入國管理法5條1項14號，2星期內去過湖北省的外國人及持有湖北省發行護照的外國人原則上禁止入境日本[36][37]。
- 1月27日，日本政府宣佈，準備將新型冠狀病毒引發的感染症指定為感染症法6條8項的「指定感染症」[38]；28日，政令在內閣會議獲通過[39]，2月1日施行[36]。當局可依法進行主動流行病學調查（接觸者調查），更容易地獲取確診個案及密切接觸者情況[39][40]。疾病同時被指定為檢疫法2條3項的「檢疫感染症」，全國主要港口及機場檢疫時，可對懷疑個案問話、診斷及檢查，並對船舶、飛機進行消毒等作業[39][40]。
- 同日，曾乘坐郵輪「鑽石公主號」週遊東亞各地、1月25日在香港下船的乘客，新型冠狀病毒檢測呈陽性[41]。乘客出現陽性結果時，鑽石公主號正停靠在沖繩縣的那霸港[42]。
- 同日，搭乘前一日的政府包機（第3班）回國後，住在埼玉縣國立保健醫療科學院的1人確診[43]，為同縣首宗確診個案。
本週，國立感染症研究所接獲90宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][68]。
- 2月25日，長野縣出現首宗確診個案，為2月中旬曾去北海道及東京都公幹的男性公司幹部[69]。
- 2月26日，岐阜縣出現首宗確診個案，為感染路徑及接觸者不明的男性[71]。
- 2月27日早間0時起，2星期內去過韓國的大邱市及慶尚北道清道郡的外國人禁止入境日本[72][73]。
- 2月28日，靜岡縣出現首宗確診個案，為檢測呈陰性後，20日從鑽石公主號下船，及後再次接受檢測的男性[76]。
- 2月29日，宮城縣及東北地方出現首宗確診個案，為檢測呈陰性後，20日從鑽石公主號下船，及後再次接受檢測的男性[77]。
本週，國立感染症研究所接獲197宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][80]。
- 3月2日，愛媛縣出現首宗確診個案，為女性銀行職員，2月29日確診高知縣女性的朋友，曾於2月15日一同去大阪市的Live House[81]。
- 3月3日，大分縣出現首宗確診個案，為接待顧客的女性[82]。
- 3月4日，山口縣及中國地方出現首宗確診個案，為曾去九州各地公幹的男性公司營銷職員[83]。
- 3月5日，滋賀縣出現首宗確診個案，為未去過海外的60多歲男性[85]。
- 3月6日，秋田縣出現首宗確診個案，為乘坐過鑽石公主號的60多歲男性[86]。
- 3月7日早間0時起，2星期內去過韓國慶尚北道的慶山市、安東市、永川市、漆谷郡、義城郡、星州郡、軍威郡，伊朗的庫姆省、德黑蘭省、吉蘭省的外國人禁止入境日本[88][89]。
本週，國立感染症研究所接獲264宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][93]。
- 內閣會議決定，3月9日起，請求來自中國（含香港及澳門）及韓國的入國者在指定地點度過2星期，並避免使用公共交通工具[89]。
- 3月11日早間0時起，2星期內去過伊朗的厄爾布爾士省、伊斯法罕省、加茲溫省、戈勒斯坦省、塞姆南省、馬贊德蘭省、中央省、洛雷斯坦省，意大利的威尼托大區、艾米利亞-羅馬涅大區、皮埃蒙特大區、馬爾凱大區、倫巴底大區，聖馬力諾全域的外國人禁止進入日本[94]。
- 3月13日，改正新型流行性感冒等對策特別措置法（下稱新型冠狀特措法）成立，同法開始適用於新型冠狀病毒感染症 (COVID-19) [95]。
- 3月14日，長崎縣出現首宗確診個案，為從京都府搬至壹岐市的自僱男性[97]，被認為是除北海道、本州、四國、九州、沖繩本島外的離島首次出現確診個案[97]。
本週，國立感染症研究所接獲730宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][105]。
- 3月23日，青森縣出現首宗確診個案，為70多歲男性公司經營者及妻子[106]。男性曾於9日至15日在西班牙旅行，回國後傳染給妻子的可能性較高[106]。
- 3月24日，考慮到COVID-19世界大流行，國際奧林匹克委員會 (IOC) 及東京奧組委宣佈，2020年東京奧運及殘奧將延期1年左右舉行[107]。
- 3月26日，鹿兒島縣出現首宗確診個案，為住在英國的女性公司幹部，23日返回日本[108]。
- 3月27日早間0時起，2星期內去過愛爾蘭、安道爾、意大利、愛沙尼亞、奧地利、荷蘭、瑞士、瑞典、西班牙、斯洛文尼亞、丹麥、德國、挪威、梵蒂岡、法國、比利時、葡萄牙、馬爾他、摩納哥、列支敦士登、盧森堡及伊朗全域的外國人禁止進入日本[109]。禁止入境的地方增至26國[109]。
本週，國立感染症研究所接獲1710宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][110]。
- 3月30日，富山縣出現首宗確診個案，為曾參加京都市內大學研究組畢業祝賀會的大學生，3月去歐洲旅行的學生亦有出席[111]。
- 3月31日，在山形縣內參加駕駛學校考試集訓班的神奈川縣女性確診，為同縣首宗確診個案[112]。
- 4月3日早間0時起，2星期內去過印度尼西亞、新加坡、泰國、大韓民國、台灣、中華人民共和國、菲律賓、汶萊、越南、馬來西亞、澳洲、新西蘭、美利堅合眾國、加拿大、厄瓜多爾、智利、多米尼克、巴拿馬、巴西、玻利維亞、阿爾巴尼亞、阿美尼亞、英國、北馬其頓、塞浦路斯、希臘、克羅地亞、科索沃、斯洛伐克、塞爾維亞、捷克、匈牙利、芬蘭、保加利亞、波蘭、波斯尼亞和黑塞哥維那、摩爾多瓦、蒙特尼哥羅、拉脫維亞、立陶宛、羅馬尼亞、以色列、土耳其、巴林、埃及、科特迪瓦、剛果民主共和國、毛里裘斯及摩洛哥全域的外國人禁止入境日本[113]。禁止入境的地方增至73個國家及地區[113]。
- 4月5日，日本國內累計死亡個案超過100宗[114]。同日，東京都累計確診個案超過1000人[114]。
本週，國立感染症研究所接獲1218宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][125]。
- 4月29日早間0時起，2星期內去過安提瓜和巴布達、聖基茨和尼維斯、多米尼加共和國、巴巴多斯、秘魯、烏克蘭、白俄羅斯、俄羅斯、阿拉伯聯合酋長國、阿曼、卡塔爾、科威特、沙特阿拉伯及吉布提全域的外國人禁止入境日本[126]。禁止入境的地方增至87個國家及地區[126]。
- 5月2日，日本國內累計死亡個案超過500宗[127]。
本週，國立感染症研究所接獲154宗呈報個案（含懷疑個案）[註 1][134]。
- 5月21日，日本政府決定，解除緊急事態宣言仍生效的8個「特定警戒都道府縣」中，京都、大阪、兵庫等關西2府1縣的緊急事態宣言[135]。
- 9月18日，眾議員高鳥修一確診2019冠狀病毒病，這是日本首位確診該疾病的國會議員[153]。
- 10月1日起，日本政府允許全球所有國家及地區的商務及留學人員等長期簽證持有者有條件入境日本[154]。
- 10月30日，日本累計確診個案突破100,000例。
- 1月7日，日本首相菅義偉發佈「緊急事態宣言」，宣佈東京都和埼玉、千葉、神奈川3縣從1月8日起進入為期一個月的緊急事態，1月13日，緊急狀態區域擴大至其他7個都道府縣。
- 1月10日，從巴西入境日本的4名旅客被確診感染變異新冠病毒，這種變異病毒與英國和南非發現的變異新冠病毒有所不同[155]。
- 3月16日，神奈川縣兩名變異新冠病毒感染者死亡。這是日本首次報告感染變異新冠病毒死亡病例[156]。
- 8月6日，日本2019冠狀病毒病確診人數超過100萬人。
2022年2月3日，傳播速度最快的奧密克戎毒株使日本新增確診為104472人，刷新確診人數新高。但並未發表「緊急事態宣言」，轉而發佈針對部分高風險地區的「防止蔓延等重點措施」，且不再要求餐飲娛樂門店必須歇業。目前新增確診人數落回到每日2萬人左右。
自3月1日起放寬入境政策。3月16日正式宣佈18個主要都道府縣將在21號全面解禁，政府通過以補貼旅行者的形式刺激旅遊業，加速日本經濟復甦。除仍需佩戴口罩外，社會將大體回歸日常。從4月8日起，解除對英、美、法等106個國家的入境限制禁令。5月4日，日本單日新增新冠肺炎確診病例26469例，新增死亡病例20例，累計確診7986萬例，累計死亡29710例。
7月，日本出現第七波疫情。[157]
7月14日，日本2019冠狀病毒病確診人數超過1000萬人，並列為主要國家。
從9月7日起，日本將入境人數上限從每天2萬人提高到每天5萬人。[158]
12月30日起，日本將加強入境防疫措施。對於從中國大陸赴日及七天內去過中國的所有人員，將實施入境時檢測。[159]該時外國旅客入境日本需持接種三次的疫苗接種證明和出發前72小時核酸陰性證明。[160]如果被檢測出陽性，原則上會進行7天隔離。[161]
2022年12月至2023年1月，日本出現第八波疫情。[162]
1月27日，日本政府的新冠對策本部舉行會議，正式決定5月8日起將新冠感染下調為《感染症法》所規定的第5類感染症，與季節性流感歸為同一等級。[163]
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