花莖草科（學名：Francoaceae）是被子植物薔薇類無患子目的一個科，只有兩屬—花莖草屬和Tetilla屬，每屬都只包括一個唯一種，都是原生於智利山區的特有種，花莖草可以長到一米高，是多年生草本植物，粉色有紅色斑點的小花在夏季開放，聚合成總狀花序，已經被許多地方引種為栽培觀賞植物。
1981年的克朗奎斯特分類法將花莖草科作為一個亞科列入虎耳草科，1998年根據基因親緣關係分類的APG 分類法將其單獨列為一個科，屬於牻牛兒苗目，2003年經過修訂的APG II 分類法認為可以選擇性地和蜜花科合併。
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