病毒分類表

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本頁面列出了病毒的分類,包含病毒以及類病毒普利昂蛋白衛星病毒亞病毒因子

生物分類表

由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代,因此在種別的定義上與一般生物有所不同。

概論

ICTV 分類法

國際病毒分類委員會(英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,簡稱 ICTV)是國際微生物學聯合會(英文:International Union of microgical Societies)發展、改進和維護通用病毒分類的唯一機構,在1966年建立起了一個病毒分類的通用系統和統一的命名法則。第七屆 ICTV 會議首次規範化了病毒物種的概念,即病毒分類的分支層次中的最低分類單元[1]。分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。

到目前為止只有一小部分的病毒得到了研究,從來自人體的病毒樣品中發現有20%的序列是未曾發現過的,而來自環境中(如海水、大洋沉積物等)的病毒樣品則大部分的序列都是全新的[2]

病毒分類從域開始,結構如下,分類後綴在括號中:[3]

英語Realm (virology) Realm(-viria
亞域 Subrealm(-vira
Kingdom(-viriae
亞界 Subkingdom(-virites
Phylum(-viricota
亞門 Subphylum(-viricotina
Class(-viricetes
亞綱 Subclass(-viricetidae
Order(-virales
亞目 Suborder(-virineae
Family(-viridae
亞科 Subfamily(-virinae
Genus(-virus
亞屬 Subgenus(-virus
Species

物種名稱通常以[疾病]病毒的形式出現,尤其是高等動植物。 ICTV 2023版分類表中總共有6個域、10個界、18個門、2個亞門、41個綱、81個目、11個亞目、314個科、200個亞科、3522個屬、84個亞屬與14690個種。除亞域、亞界和亞綱外,其他級別的分類單元都被使用。共有6個域、1個地位未定綱、22個地位未定科及2個地位未定屬被承認[4]

巴爾的摩分類法

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巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的合成方式

諾貝爾獎獲得者生物學家戴維·巴爾的摩在1970年代提出了巴爾的摩分類系統[5]。巴爾的摩分類法與ICTV分類法一起用於現代病毒的分類[6][7][8]

巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的生成機制。在從病毒基因組到蛋白質的過程中,必須要生成mRNA來完成蛋白質合成和基因組的複製,但每一個病毒家族都採用不同的機制來完成這一過程。病毒基因組可以是單鏈或雙鏈的 RNADNA,可以有也可以沒有反轉錄酶。而且,單鏈RNA病毒可以是正義(+)或反義(-)。這一分類法將病毒分為7類:

舉一個病毒分類的例子:水痘病毒,即帶狀疱疹病毒,屬於疱疹病毒目疱疹病毒科甲型疱疹病毒亞科水疱病毒屬;同時,帶狀疱疹病毒是巴爾的摩分類法中的第一類,因為它是雙鏈 DNA 病毒,且不含有反轉錄酶。

ICTV 2023版病毒分類表

此套分類系統與細胞生物分類系統有許多共同特徵,如分類單元結構,但也存在一些差異,比如所有分類名稱都使用斜體,這與國際藻類、真菌和植物命名法國際動物命名法不同。

A型DNA病毒域 Adnaviria

  • 齊利希病毒界 Zilligvirae 1門
    • 杆狀病毒門 Taleaviricota 1綱
      • 線狀病毒綱 Tokiviricetes 3目
        • 細帶病毒目 Ligamenvirales 2科
        • 墨洗門病毒目 Maximonvirales
          • 阿·蒙病毒科 Ahmunviridae
        • 第一病毒目 Primavirales 1科
          • 三層病毒科 Tristromaviridae
  • 香港病毒界 Heunggongvirae 2門
    • 衣殼病毒門 Peploviricota 1綱
    • 尾噬菌體門 Uroviricota 1綱
      • 有尾噬菌體綱 Caudoviricetes 1目
        • 有尾噬菌體目 Caudovirales
        • crAss噬菌體目 Crassvirales
          • 腸道噬菌體科 Crevaviridae
          • 腸子噬菌體科 Intestiviridae
          • 腸管噬菌體科 Steigviridae
          • 腸噬菌體科 Suoliviridae
        • 海港噬菌體目 Juravirales
          • 鹽港噬菌體科 Yangangviridae
          • 鹽滷卡噬菌體科 Yanlukaviridae
        • 千面噬菌體目 Kirjokansivirales
          • 變殖噬菌體科 Graaviviridae
          • 泛鹽噬菌體科 Haloferuviridae
          • 魚尾噬菌體科 Pyrstoviridae
          • 短尾鹽噬菌體科 Shortaselviridae
        • 海洋組噬菌體目 Magrovirales
          • 敖廣噬菌體科 Aoguangviridae
        • 甲烷杆噬菌體目 Methanobavirales
          • 厭氧噬菌體科 Anaerodiviridae
          • 具刺噬菌體科 Armatusviridae
          • 開羅噬菌體科 Kairosviridae
          • 萊氏噬菌體科 Leisingerviridae
          • Pigerviridae
        • 納孔噬菌體目 Nakonvirales
          • 阿·普切噬菌體科 Ahpuchviridae
          • 艾克·曲瓦噬菌體科 Ekchuahviridae
        • 蘇雷瑪噬菌體目 Thumleimavirales
          • 鹽噬菌體科 Druskaviridae
          • 富鹽噬菌體科 Hafunaviridae
          • 嗜鹽大噬菌體科 Halomagnusviridae
          • 鹽場噬菌體科 Soleiviridae
        • 埃凱曼病毒科 Ackermannviridae
        • 集聚噬菌體科 Aggregaviridae
        • 艾莉絲·埃文斯噬菌體科 Aliceevansviridae
        • 阿倫伯格噬菌體科 Arenbergviridae
        • 規範噬菌體科 Assiduviridae
        • 自複製短尾噬菌體科 Autographiviridae
        • 卡斯金斯噬菌體科 Casjensviridae
        • 蔡斯噬菌體科 Chaseviridae
        • Chimalliviridae
        • Clermontviridae
        • 德默萊茲噬菌體科 Demerecviridae
        • 德雷克斯勒噬菌體科 Drexlerviridae
        • 杜恩噬菌體科 Duneviridae
        • 熱噬菌體科 Fervensviridae
        • 凡賽提噬菌體科 Forsetiviridae
        • 弗雷德·法斯蒂爾噬菌體科 Fredfastierviridae
        • 格里蒙噬菌體科 Grimontviridae
        • 格蘭噬菌體科 Guelinviridae
        • 赫爾戈蘭噬菌體科 Helgolandviridae
        • 赫萊爾噬菌體科 Herelleviridae
        • 克列茲考斯卡噬菌體科 Kleczkowskaviridae
        • Konodaiviridae
        • 藍綠噬藻體科 Kyanoviridae
        • Lutetiaviridae
        • 瑪薩噬菌體科 Madisaviridae
        • 馬德里噬菌體科 Madridviridae
        • 梅西揚日諾夫噬菌體科 Mesyanzhinovviridae
        • 莫利可噬菌體科 Molycolviridae
        • 友好噬菌體科 Naomviridae
        • 奧拉-詹森噬菌體科 Orlajensenviridae
        • 厚噬菌體科 Pachyviridae
        • P2噬菌體科 Peduoviridae
        • 漫遊噬菌體科 Pervagoviridae
        • 普切斯噬菌體科 Pootjesviridae
        • 刺噬菌體科 Pungoviridae
        • 朗特里噬菌體科 Rountreeviridae
        • 薩弗曼噬菌體科 Saffermanviridae
        • 薩拉瑪噬菌體科 Salasmaviridae
        • 豬尾噬菌體科 Saparoviridae
        • 斯基托噬菌體科 Schitoviridae
        • 希望噬菌體科 Speroviridae
        • 斯坦·威廉噬菌體科 Stanwilliamsviridae
        • 斯特拉波噬菌體科 Straboviridae
        • 鹽菌噬菌體科 Suolaviridae
        • 富山噬菌體科 Toyamaviridae
        • 梅園噬菌體科 Umezonoviridae
        • 維爾丹尼噬菌體科 Verdandiviridae
        • 翻轉噬菌體科 Vertoviridae
        • VLM群噬菌體科 Vilmaviridae
        • 維諾噬菌體科 Winoviridae
        • Zierdtviridae
        • 佐貝爾噬菌體科 Zobellviridae

包含4界

  • 洛布病毒界 Loebvirae 1門
  • 桑格病毒界 Sangervirae 1門
  • 稱徳病毒界 Shotokuvirae 2門
    • 科薩特病毒門 Cossaviricota 3綱
    • 單環編碼病毒門 Cressdnaviricota 2綱:編碼複製相關蛋白的環狀單鏈 DNA 病毒(Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses,CRESS DNA viruses)
      • 精氨酸指針病毒綱 Arfiviricetes 5目
        • 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
          • 硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae
        • 圓環病毒目 Cirlivirales 3科
          • 圓環病毒科 Circoviridae
          • 內蜒病毒科 Endolinaviridae
          • 維雅病毒科 Vilyaviridae
        • CRESS亞基因組目 Cremevirales 1科
          • 小環狀 DNA 病毒科 Smacoviridae
        • 連環病毒目 Gredzevirales
          • 長蛇病毒科 Gandrviridae
          • 銜尾病毒科 Ouroboviridae
        • 耶夢病毒目 Jormunvirales
          • 德羅普尼病毒科 Draupnirviridae
        • 多分體基因病毒目 Mulpavirales 3科
          • 動物CRESS病毒科 Anicreviridae
          • 中介病毒科Metaxyviridae
          • 矮縮病毒科 Nanoviridae
        • 圓形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
          • 圓形病毒科 Redondoviridae
        • 戒環病毒目 Ringavirales
          • 秘魯圓環樣病毒科 Pecoviridae
        • 幽谷病毒目 Rivendellvirales
          • 納雅病毒科 Naryaviridae
        • 洛汗病毒目 Rohanvirales
          • 白石病毒科 Adamaviridae
          • 異圓環病毒科 Kirkoviridae
          • 能雅病毒科 Nenyaviridae
        • 鎮星病毒目 Saturnivirales
          • 豐茂病毒科 Kanorauviridae
          • 多源病毒科 Mahapunaviridae
      • Rep 單鏈編碼病毒綱 Repensiviricetes 1目
  • 特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1門
    • 嗜鹽病毒門 Saleviricota 1綱
      • 凌亂病毒綱 Huolimaviricetes 1目
        • 鹽藻病毒目 Haloruvirales 1科
          • 嗜鹽菌多形病毒科 Pleolipoviridae

核糖病毒域 Riboviria

包含2界、2科、4屬

核酶病毒域 Ribozyviria

包含2界

  • 班福病毒界 Bamfordvirae 2門
    • 核質病毒門 Nucleocytoviricota 2綱
      • 巨病毒綱 Megaviricetes 3目
        • 藻類病毒目 Algavirales 1科
        • 模擬病毒目 Imitervirales
          • 異擬菌病毒科 Allomimiviridae
          • 中擬病毒科 Mesomimiviridae
          • 擬菌病毒科 Mimiviridae
            • 次擬菌病毒亞科 Aliimimivirinae
            • 克堡病毒亞科 Klosneuvirinae
            • 巨大擬菌病毒亞科 Megamimivirinae
          • 分擬菌病毒科 Schizomimiviridae
        • 闊虹馬囊病毒目 Pimascovirales 3科
          • 囊泡病毒科 Ascoviridae
          • 雪松病毒科 Cedratviridae
          • 虹彩病毒科 Iridoviridae 2亞科
          • 馬賽病毒科 Marseilleviridae
          • 變形病毒科 Orpheoviridae
          • 闊口罐病毒科 Pithoviridae
        • 魔物病毒科 Mamonoviridae
      • 痘疹病毒綱 Pokkesviricetes 2目
    • 質體前體病毒門 Preplasmiviricota 3綱
      • 單體病毒綱 Ainoaviricetes
        • 勞塔莫病毒目 Lautamovirales
          • 芬蘭湖病毒科 Finnlakeviridae
      • 獨特病毒綱 Maveriviricetes
        • 多變五鄰體病毒目 Divpevirales
          • 瘤胃噬病毒體科 Ruviroviridae
        • 大病毒依賴病毒目 Lavidavirales
          • 獨特噬病毒科 Maviroviridae
        • 擬菌依賴病毒目 Mividavirales
          • 伴星噬病毒科 Sputniviroviridae
        • 依賴病毒目 Priklausovirales 1科
          • 勃爾頓噬病毒體科 Burtonviroviridae
          • 滴水湖噬病毒體科 Dishuiviroviridae
          • 格列佛噬病毒體科 Gulliviroviridae
          • 彌澤噬病毒體科 Omnilimnoviroviridae
      • 聚整合轉座子病毒綱 Polintoviricetes 1目
        • 正聚整合轉座子病毒目 Orthopolintovirales 1科
          • 腺整合轉座子病毒科 Adintoviridae
      • 保護病毒綱 Tectiliviricetes
    • 雅拉病毒科 Yaraviridae
  • 海爾維蒂病毒界 Helvetiavirae(瑞士病毒)1門

地位未定種類

地位未定綱:

  • 節肢動物核大DNA病毒綱 Naldaviricetes 1目、1科
    • 晚期因子病毒目 Lefavirales 3科
      • 杆狀病毒科 Baculoviridae 4屬
      • 肥大唾腺炎病毒科 Hytrosaviridae(線頭病毒科)2屬
      • 裸杆狀病毒科 Nudiviridae 4屬
    • 線極病毒科 Nimaviridae 1屬

地位未定科:

地位未定屬:

  • 溝鞭藻 DNA 病毒屬 Dinodnavirus 1種
  • 壺菌病毒屬 Rhizidiovirus 1種

亞病毒因子(Subviral Agents)

衛星(Satellites)

  • 衛星病毒 Satellite virus
    • 單鏈核糖核酸衛星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
    • 雙鏈 DNA 衛星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
    • 未定屬
  • Satellite nucleic acid
    • Single-stranded satellite DNA
    • Double-stranded satellite RNA
    • Single-stranded satellite RNA
    • RNA satellite
    • 未定屬

類病毒(Viroids)

  • Pospiviroidae
    • Pospiviroid
    • Hostuviroid
    • Cocadviroid
    • Apscaviroid
    • Coleviroid
    • 未定屬
  • Avsunviroidae
    • Avsunviroid
    • Pelamoviroid
    • Elaviroid
  • 未定科

朊毒體(Prions)

  • Mammal-prion
  • Fungi-prion

干擾缺損病毒(Defective Interfering)

  • 缺損干擾 RNA Defective Interfering RNA
  • Defective interfering particle

參考文獻

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