忠誠的星際戰士會不時有少數人或整個戰團變節或遭受混沌腐化的情形發生，同樣的，混沌星際戰士也會因為不同的原因形成小型的部隊例如會因內鬥、相互攻防等原因而分裂，又或者是原本的散兵受到特定人物吸引而群聚起來，大多數的軍團或戰團因內鬥或相互攻防而分裂成了規模不一的戰幫(Warbands)，這些混沌星際戰士軍團、戰團或戰幫仍持續的侵擾帝國與其他種族。
- 鞭撻者(The Scourged)： 戰團長Gallus Herodicus曾是一位受人尊敬的阿斯塔特修士，直到他的戰團—求真者—被要求去處決無辜之人，對此他深感焦慮。這種不義之舉鞭撻着他的靈魂。在深夜，Herodicus懇求一種方法去了解一個人是否在說謊。不幸的是，大神奸奇（Tzeentch）聽到了，並且他回應了懇求者。從此刻開始，Herodicus和他的戰友們可以識別出任何一個人說的任何一個謊言並在不久後正式成為了背叛者。
- 紅海盜（Red Corsairs）：前身為星空之爪（Astral Claws）戰團。星空之爪戰團在M41時期變節，現在稱之為紅海盜，而他們之前的戰團長休倫現在更為人所知的稱呼則是黑心休倫。星空之爪是在M35中期作為遠征戰團所建立的，他們的母團尚且未知的，儘管對他們的基因種子穩定性和戰鬥策略的推測指向要可能是極限戰士或者是暗黑天使。作為一個變節戰團，他們被宣佈為被逐出帝國的叛徒，並且該戰團的任何記錄都被標記為被銷毀。
- 猩紅屠殺者（Crimson Slaughter）：深紅軍刀的成員們聲稱烏米迪亞的所有公民都陷入了混沌崇拜中。來自異端審判庭的報告將星際戰士們定罪，認定深紅軍刀的行動遠遠超出了剷除某些隱藏邪教的範圍，而是一種屠宰行為。與此同時，深紅軍刀們開始出現奇怪的症狀。他們的多重心跳毫無目的地加速到巔峰值，或者開始有一種不祥的預感，彷彿有某種看不見的迷霧正在包圍着他們。不斷上升的壓力沉重地壓在他們的心頭。甚至在任務完全完成，深紅軍刀返回軌道艦隊之前，他們中的一些成員已經感受到了之後被稱為「縈繞」（the haunting）的最初影響。戰團長希瓦圖斯·克拉農也感到越來越不安。然而在到達迪米特拉短暫的旅途中，戰團的偏執和瘋狂與日俱增。並不是深紅軍刀降落在了迪米特拉上，而是極端的狂人。出於一種本能要燒掉縈繞在他們心頭的痛苦記憶的嘗試，這些身着紅甲的星際戰士們忘記了他們所有的計劃，一心只專註一件事: 屠殺。他們用爆矢、飛行器和軌道轟炸狠狠地屠戮了星球居民。使戰團感到驚奇的是，他們腦子裏痛苦的聲音在大屠殺之後就消失了。在迪米特拉大屠殺後不久，深紅軍刀就被宣佈為除名叛徒。希瓦圖斯·克拉農將深紅軍刀改名猩紅屠殺者。