帕特里克·克拉瑪(德語:Patrick Cramer,1969年2月3日—),德國化學家、結構生物學家、分子系統生物學家,2020年當選美國國家科學院外籍院士[1],2023年6月當選馬克斯·普朗克學會主席。
帕特里克·克拉瑪 Patrick Cramer | |
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出生 | 西德斯圖加特 | 1969年2月3日
國籍 | 德國 |
母校 | 斯圖加特大學 海德堡大學 |
獎項 | 戈特弗里德·威廉·萊布尼茨獎 (2006年) 恩斯特·榮格醫學獎 (2009) 路易斯—珍特醫學獎 (2021年) 邵逸夫獎 (2023年) |
網站 | www |
科學生涯 | |
研究領域 | 生物化學 |
機構 |
生平
帕特里克·克拉瑪1989年至1995年就讀於斯圖加特大學和海德堡大學化學系[2]。後來他負笈英國布里斯托大學,以伊拉斯謨計劃學者身份完成個人部分研究。在英國擔任研究生期間,他還供職於劍橋分子生物學實驗室的艾倫·費斯特爵士實驗室。1995年至1998年,他來到法國格勒諾布爾,在歐洲分子生物學實驗室出任克里斯托夫·W·穆勒(Christoph W. Müller)實驗室的博士生。1998年,他在海德堡大學獲得自然科學博士[2]。1999年至2001年,克拉瑪在美國史丹福大學羅傑·科恩伯格(後來於2006年獲得諾貝爾化學獎)的實驗室從事博士後工作,並擔任德國科學基金會會士[3]。
2001年,克拉瑪回到德國,出任慕尼黑大學基因中心生物化學終身教授,2004年擔任中心全職教授。隨後在2004年至2013年,克拉瑪擔任中心主任[4]。在此期間,他於2007年至2009年出任化學與藥學院院長,2010年至2013年出任生物化學系主任[2]。他還在2007年至2013年擔任大學研究委員會委員,也是德國科學基金會研究資助網絡SFB464的發言人。[來源請求]
2014年1月1日,克拉瑪出任德國哥廷根馬克斯·普朗克生物物理化學研究所所長[2][5]。
研究成果
在馬克斯·普朗克生物物理化學研究所擔任分子生物學部主任期間,克拉瑪依展開了基礎研究[8]。他還在哥廷根大學擔任科學主管及名譽教授。與羅傑·科恩伯格進行博士後研究期間,克拉瑪依確認了細胞核最大酶RNA聚合酶Ⅱ的三維原子結構,為科恩伯格2006年奪得諾貝爾化學獎的真核轉錄分子基礎研究發揮關鍵作用[9]。
克拉瑪的實驗室研究真核細胞分子機制,以及其進行基因轉錄的系統性原則。實驗室綜合運用各種結構生物研究方法,包括X射線晶體學、低溫電子顯微鏡和生物化學工具。實驗室還利用功能基因組學和計算生物學方法來研究活細胞的轉錄原則[8]。
克拉瑪的小組製作了第一部關於轉錄啟動及延伸的分子電影[10]。此外,克拉瑪整合分子生物學和系統生物學的各個方面,研發出分析細胞內RNA代謝各基礎方面的方法。他的長期目標是了解基因組的表現及調節。因此,他的實驗室開創出一種結合結構和全基因組方法的研究方法,稱為分子系統生物學。
2020年4月,克拉瑪團隊打造了2019冠狀病毒的首個「冠狀聚合酶3D結構」[11]。該模型能讓研究人員「研究瑞德西韋等抗病毒藥物阻斷聚合酶的的工作原理,尋找新的抑制物質」[11]。
克拉瑪也投身於德國及整個歐洲生命科學的進一步發展。他是慕尼黑綜合蛋白質科學中心的創辦人之一,是慕尼黑分子生物系統研究中心新研究樓建設工程的發起人。此外,克拉瑪還是巴伐利亞州政府科學技術顧問委員會成員,在TTN研究所從事生物倫理學工作。克拉瑪依還擔任多個國際會議的組織者,同時兼任多個科學委員會和顧問委員會委員。自2016年起,克拉瑪擔任歐洲分子生物學實驗室理事會聯合理事長[12]。
部分著作
- Schwalb, Björn; Michel, Margaux; Zacher, Benedikt; Frühauf, Katja; Demel, Carina; Tresch, Achim; Gagneur, Julien; Cramer, Patrick. TT-seq maps the human transient transcriptome. Science. 2016-06-03, 352 (6290): 1225–1228. Bibcode:2016Sci...352.1225S. ISSN 0036-8075. PMID 27257258. S2CID 8549873. doi:10.1126/science.aad9841.
- Plaschka, C.; Hantsche, M.; Dienemann, C.; Burzinski, C.; Plitzko, J.; Cramer, P. Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening. Nature. 2016, 533 (7603): 353–358. Bibcode:2016Natur.533..353P. PMID 27193681. S2CID 4465762. doi:10.1038/nature17990.
- Bernecky, Carrie; Herzog, Franz; Baumeister, Wolfgang; Plitzko, Jürgen M.; Cramer, Patrick. Structure of transcribing mammalian RNA polymerase II. Nature. 2016, 529 (7587): 551–554. Bibcode:2016Natur.529..551B. PMID 26789250. S2CID 4404463. doi:10.1038/nature16482. hdl:11858/00-001M-0000-0029-7D45-3 .
- Plaschka, C.; Larivière, L.; Wenzeck, L.; Seizl, M.; Hemann, M.; Tegunov, D.; Petrotchenko, E. V.; Borchers, C. H.; Baumeister, W. Architecture of the RNA polymerase II–Mediator core initiation complex. Nature. 2015, 518 (7539): 376–380. Bibcode:2015Natur.518..376P. PMID 25652824. S2CID 4450934. doi:10.1038/nature14229. hdl:11858/00-001M-0000-0024-CED0-5 .
- Schulz, Daniel; Schwalb, Bjoern; Kiesel, Anja; Baejen, Carlo; Torkler, Phillipp; Gagneur, Julien; Soeding, Johannes; Cramer, Patrick. Transcriptome surveillance by selective termination of noncoding RNA synthesis. Cell. 2013-11-21, 155 (5): 1075–1087. ISSN 1097-4172. PMID 24210918. doi:10.1016/j.cell.2013.10.024 .
- Kostrewa, Dirk; Zeller, Mirijam E.; Armache, Karim-Jean; Seizl, Martin; Leike, Kristin; Thomm, Michael; Cramer, Patrick. RNA polymerase II–TFIIB structure and mechanism of transcription initiation. Nature. 2009, 462 (7271): 323–330. Bibcode:2009Natur.462..323K. PMID 19820686. S2CID 205218821. doi:10.1038/nature08548. hdl:11858/00-001M-0000-0015-8570-1 .
- Bushnell, David A.; Cramer, Patrick; Kornberg, Roger D. Structural basis of transcription: α-Amanitin–RNA polymerase II cocrystal at 2.8 Å resolution. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2002-02-05, 99 (3): 1218–1222. Bibcode:2002PNAS...99.1218B. ISSN 0027-8424. PMC 122170 . PMID 11805306. doi:10.1073/pnas.251664698 .
- Cramer, P.; Bushnell, D. A.; Fu, J.; Gnatt, A. L.; Maier-Davis, B.; Thompson, N. E.; Burgess, R. R.; Edwards, A. M.; David, P. R. Architecture of RNA polymerase II and implications for the transcription mechanism. Science. 2000-04-28, 288 (5466): 640–649. Bibcode:2000Sci...288..640C. ISSN 0036-8075. PMID 10784442. doi:10.1126/science.288.5466.640. hdl:11858/00-001M-0000-0015-872F-3 .
- Plaschka, Clemens; Nozawa, Kayo; Cramer, Patrick. Mediator Architecture and RNA Polymerase II Interaction. Journal of Molecular Biology. 2016, 428 (12): 2569–2574. ISSN 0022-2836. PMID 26851380. doi:10.1016/j.jmb.2016.01.028.
- Sainsbury, Sarah; Bernecky, Carrie; Cramer, Patrick. Structural basis of transcription initiation by RNA polymerase II. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2015, 16 (3): 129–143. ISSN 1471-0072. PMID 25693126. S2CID 32487971. doi:10.1038/nrm3952.
- Cramer, Patrick. A Tale of Chromatin and Transcription in 100 Structures. Cell. 2014, 159 (5): 985–994. ISSN 0092-8674. PMID 25416940. S2CID 8634234. doi:10.1016/j.cell.2014.10.047. hdl:11858/00-001M-0000-0024-44B9-9 .
- Cheung, Alan C.M.; Cramer, Patrick. A Movie of RNA Polymerase II Transcription. Cell. 2012, 149 (7): 1431–1437. ISSN 0092-8674. PMID 22726432. S2CID 18405467. doi:10.1016/j.cell.2012.06.006 .
- Cramer, Patrick. Deciphering the RNA polymerase II structure: a personal perspective. Nature Structural & Molecular Biology. 2006, 13 (12): 1042–1044. ISSN 1545-9993. PMID 17146456. S2CID 31141435. doi:10.1038/nsmb1206-1042.
- Aufbruch in die molekulare Systembiology. - Essay for the anniversary edition "20 Jahre Laborjournal", Published in Laborjournal on 11 July 2014.
- Entwicklungen in der Biomedizin: Genom-Sequenzierung in Diagnose, Prävention und Therape; Systembiologie und Medizin. In: T. Rendtorff (Hrsg.): Zukunft der biomedizinischen Wissenschaften. Nomos, 2013, ISBN 978-3-8487-0849-9.
- O. Primavesi, P. Cramer, R. Hickel, T. O. Höllmann; W. Schön: Lob der Promotion. Published in Frankfurter Allgemeine Zeitung on 19 July 2013.
- J. Hacker, T. Rendtorff, P. Cramer, M. Hallek, K. Hilpert, C. Kupatt, M. Lohse, A. Müller, U Schroth, F. Voigt, M. Zichy. Biomedizinische Eingriffe am Menschen – Ein Stufenmodell zur ethischen Bewertung von Gen- und Zelltherapie. Water de Gruyter, Berlin. ISBN 978-3-11-021306-5 (2009).
主要獎項榮譽
- 2000年:歐洲分子生物學組織青年研究員獎(Young Investigator Award)[2]
- 2000年:分子結構公司未來研究員獎(MSC Future Investigator Award)[2]
- 2002年:葛蘭素史克科學獎[13]
- 2004年:第10屆歐洲青年研究人員艾本多夫獎[2]
- 2006年:戈特弗里德·威廉·萊布尼茨獎[14]
- 2008年:烏特勒支大學貝福特生物分子研究中心貝福特獎章[15]
- 2009年:恩斯特·榮格醫學獎[16]
- 2009年:拜耳科教基金會漢森家族獎[17]
- 2009年:利奧波第那科學院院士[18]
- 2009年:歐洲分子生物學實驗室成員[19]
- 2010年:歐洲研究理事會高級資助者[2]
- 2010年:羅伯特·科赫研究所榮譽勳章[2]
- 2011年:菲爾德伯格基金會獎[20]
- 2012年:瓦萊基金會(Vallee Foundation)客座教授[21]
- 2012年:德意志聯邦共和國功績勳章[22]
- 2012年:保拉與理查德·馮·赫特維格獎(Paula und Richard von Hertwig Preis)
- 2015年:亞瑟·伯克哈德獎(Arthur Burkhardt Preis)[23]
- 2015年:瑞典卡羅林斯卡學院客座教授[24]
- 2016年:歐洲研究理事會高級資助者[25]
- 2016年:英國生物化學學會世紀獎[2]
- 2017年:歐洲科學院院士[26]
- 2017年:哥廷根大學名譽教授[2][27]
- 2017年:日內瓦大學讓·韋格爾講座[2]
- 2018年:密歇根大學首屆喬治·威廉·喬丹(George William Jourdian)講座[28]
- 2019年:恩斯特·謝靈獎[29]
- 2020年:奧托·瓦爾堡獎章[30]
- 2021年:路易斯·珍特醫學獎[31]
- 2023年:邵逸夫獎[32]
參考資料
外部連結
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