本旗幟列表展示的是部分國家的元首專用旗幟，例如總統旗（President Standard）、皇家旗（Royal Standard）等。
國家元首旗幟的設計，通常是在國旗的基礎上增加一些文字圖案（例如國徽）、比例調整版本，或者以國旗為藍本重新設計等等。
世界上絕大部分國家設有國家元首旗幟（通常為總統制、君主制國家），不過有一些國家，例如中華人民共和國、越南、老撾等，不設置國家元首旗幟。
以下國家（包括有限承認國家）依其英文名稱首字母排序。
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多米尼加總統（海上用） -
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以色列總統 -
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瑞典國王（軍事） -
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歷史上國家元首旗幟列表
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多米尼加總統（舊版本） -
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烏克蘭酋長 -
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