南蘇丹的城鎮列表如下，人口數據是2010年估計：
| 城市 | 人口 | 縣 | 州/行政區 |
|---|---|---|---|
| 阿卜耶伊* | 20,000 | 阿卜耶伊地區 | |
| 阿維爾 | 100,000 | Aweil municipality | 阿維爾州 |
| 班提烏 | 7,700 | 團結州 | |
| 博爾 | 26,800 | Bor South County | 瓊萊州 |
| 朱巴 | 372,410 | 朱貝克州 | |
| 夸喬克 | 78,111 | 戈格里亞勒州 | |
| 馬拉卡勒 | 139,450 | Malakal County | 上尼羅州 |
| 尼穆萊 | 45,000 | Magwi County | 伊馬通州 |
| 倫貝克 | 32,100 | Rumbek Central County | 湖泊州 |
| 通季 | 17,340 | Tonj Municipality | 通季州 |
| 托里特 | 20,050 | Torit County | 伊馬通州 |
| 瓦烏 | 151,320 | 瓦烏州 | |
| 延比奧 | 40,400 | Yambio County | 西赤道州 |
| 耶伊 | 185,000 | 耶伊河州 | |
| 伊羅勒 | 11,650 | 湖泊州 |
- 自2011年7月9日南蘇丹獨立之日起，阿卜耶伊的地位有爭議。
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