分子系統發生學(Molecular phylogenetics)是分析遺傳分子差異(主要是DNA序列)的系統發生學的一個分支,以獲得有機體進化關係的信息。分子系統發生學分析的結果在系統發生樹(phylogenetic tree)中表達。分子系統發生學是分子系統分類學的一個方面,更廣泛的術語還包括在生物分類學和生物地理學中使用分子數據。
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分子系統發生學和分子演化相關。 分子進化是在生命樹(進化)的各個分支中在分子水平(基因,蛋白質等)上選擇性變化(突變)的過程。 分子系統發育學推斷由於分子進化而產生的進化關係,並導致系統發育樹的構建。 根據1870年代Haeckel所知的信息,右邊顯示的圖描繪了生命系統樹作為最早的詳細樹木之一。
分子系統發生學的出現,很可能會改變大眾對舊有動物分類的認識。舉例說:傳統上鱗翅目物種皆二分為蛾跟蝴蝶兩大分支,但研究認為其實所有蝶類皆應歸類到鳳蝶總科去,而鳳蝶總科又是鱗翅目之中、有喙亞目之中、真鱗翅類之中、真異脈類之中、雙孔亞目之中、短突雙孔類之中、螟蛾類中的一個演化支[1]。類似的改變還有嚙蟲總目的合併,以及白蟻被合併進蜚廉目的例子。
參考
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