蛋白質複合體(英語:protein complex)是有兩個以上功能相關的多肽鏈通過二硫鍵或其它蛋白質相互作用所形成的複合物[1]。蛋白質複合體的種類繁多,許多種的性質與功能都還不為人所知,而成為蛋白質組研究的重要的研究對象。一般蛋白質複合體可區分為結構型的蛋白質複合體和功能型蛋白質複合體兩大類。
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