臺灣總督府稅關為臺灣日治時期負責港口貨物進出口關稅、物品檢查的單位,在全台各地設有多處稅關支署、出張所及監視署。在日治初期,延續了清治時期的四處開放港口並設置稅關,關稅制度亦依舊慣,在1911年改採和日本內地相同的關稅制度。1909年,在淡水街設置了掌管全台關稅事務的臺灣總督府稅關,其在1916年遷至大稻埕;之後隨基隆港發展,在1921年轉移至基隆市,並在1934年分別設立基隆、高雄稅關。
臺灣總督府稅關於1943年被併入臺灣總督府港務局,在二戰後由海關總稅務司署接收,為現在財政部關務署基隆關、財政部關務署高雄關的前身。