蝙蝠冠狀病毒Rm1(Bat SARS CoV Rm1/2004)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,為SARS-CoV相關病毒,在中國湖北的大耳菊頭蝠樣本中發現,於2005年發表。
發現
2004年3月至11月,研究人員在中國廣東、天津、廣西與湖北四省市採集蝙蝠樣本,在湖北宜昌皮氏菊頭蝠的糞便樣本中發現SARS相關病毒,即Rm1病毒,於2005年和Rf1病毒與Rp3病毒一起發表[1]。
基因組
Rm1病毒的基因組長29749nt[2],序列與SARS-CoV的相似度為88.2%[3],其ORF8和人類以外的大多數SARSr-CoV一樣有一段長29nt的插入序列,為一完整的開放閱讀框,人類的ORF8則因缺少此序列而被分成8a與8b兩個較小的開放閱讀框。Rm1的ORF8(121個胺基酸)比人類SARS病毒ORF8輔助蛋白(121個胺基酸)少一個胺基酸,且兩者胺基酸序列相似度僅35%[1]。另外Rm1與許多蝙蝠SARSr-CoV一樣在刺突蛋白的受體結合結構域(receptor binding domain, RBD)有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失(但不見於WIV1病毒與SHC014病毒)[4]。
參考文獻
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