MADS盒蛋白（英語：MADS-box）基因是一大類與高等植物花器發育有關的調控基因，具有同源異形框基因的功能。MADS的命名由四個基因的第一個第1個字母組合而成，即酵母MCMI，擬南芥（Arabidopsis thaliana）AG（Agamous），金魚草DEFA和動物血清應激因子（SRF，serum response factor），它們都是轉錄調控蛋白，在結構上具有同源性。
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MADS盒基因可分為三大類群，即A、B和C三組，它們均有典型的MADS盒順序，在高等植物花器發育的不同位置起作用。植物花朵的結構大同小異，均有四輪器官，第一輪為花萼，第二輪為花瓣，第三輪為雄蕊，第四輪為心皮。A類基因控制外側2輪花器的分化，B類涉及第二和第三輪花器的發育，C類基因負責內部2輪花器的確定性。若發生MADS盒基因突變，花旗的位置將發生互換。這就是經典的ABC模型理論。
植物的MADS盒蛋白有四個特徵區，分別為MADS盒，I,K,C域。MADS盒含57個氨基酸，可與DNA雙螺旋的小溝專一性結合。I區為間隔順序，K區因含類角蛋白（keratin）而取名，長約70個氨基酸。C區為羧基端，順序變化較大，可與輔助因子結合啟動基因轉錄。
參考文獻
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